Protein–RNA interactions for Protein: P63328

Ppp3ca, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp3caP63328 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppp3caP63328 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppp3caP63328 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppp3caP63328 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppp3caP63328 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppp3caP63328 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppp3caP63328 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppp3caP63328 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppp3caP63328 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppp3caP63328 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppp3caP63328 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppp3caP63328 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppp3caP63328 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppp3caP63328 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppp3caP63328 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppp3caP63328 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppp3caP63328 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppp3caP63328 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppp3caP63328 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp3caP63328 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp3caP63328 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp3caP63328 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp3caP63328 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp3caP63328 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp3caP63328 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp3caP63328 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ppp3caP63328 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ppp3caP63328 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ppp3caP63328 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppp3caP63328 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp3caP63328 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp3caP63328 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp3caP63328 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp3caP63328 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp3caP63328 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp3caP63328 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp3caP63328 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppp3caP63328 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppp3caP63328 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppp3caP63328 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppp3caP63328 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppp3caP63328 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppp3caP63328 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppp3caP63328 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppp3caP63328 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppp3caP63328 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppp3caP63328 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppp3caP63328 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppp3caP63328 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppp3caP63328 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppp3caP63328 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppp3caP63328 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppp3caP63328 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppp3caP63328 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppp3caP63328 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppp3caP63328 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppp3caP63328 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppp3caP63328 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppp3caP63328 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppp3caP63328 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppp3caP63328 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppp3caP63328 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppp3caP63328 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppp3caP63328 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppp3caP63328 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppp3caP63328 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppp3caP63328 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppp3caP63328 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppp3caP63328 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppp3caP63328 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ppp3caP63328 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppp3caP63328 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppp3caP63328 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppp3caP63328 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppp3caP63328 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppp3caP63328 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppp3caP63328 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppp3caP63328 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppp3caP63328 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppp3caP63328 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppp3caP63328 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppp3caP63328 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppp3caP63328 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppp3caP63328 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppp3caP63328 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppp3caP63328 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppp3caP63328 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppp3caP63328 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppp3caP63328 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppp3caP63328 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppp3caP63328 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppp3caP63328 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppp3caP63328 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppp3caP63328 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppp3caP63328 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppp3caP63328 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppp3caP63328 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppp3caP63328 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppp3caP63328 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppp3caP63328 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms