Protein–RNA interactions for Protein: P62830

Rpl23, 60S ribosomal protein L23, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23P62830 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl23P62830 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl23P62830 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl23P62830 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl23P62830 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl23P62830 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl23P62830 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl23P62830 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rpl23P62830 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rpl23P62830 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rpl23P62830 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl23P62830 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl23P62830 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl23P62830 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl23P62830 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl23P62830 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl23P62830 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl23P62830 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl23P62830 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl23P62830 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl23P62830 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl23P62830 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl23P62830 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl23P62830 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl23P62830 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl23P62830 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl23P62830 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl23P62830 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl23P62830 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl23P62830 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl23P62830 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl23P62830 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl23P62830 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl23P62830 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl23P62830 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl23P62830 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl23P62830 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl23P62830 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl23P62830 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl23P62830 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl23P62830 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl23P62830 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl23P62830 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl23P62830 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl23P62830 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl23P62830 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl23P62830 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl23P62830 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl23P62830 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl23P62830 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl23P62830 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl23P62830 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl23P62830 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl23P62830 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl23P62830 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl23P62830 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl23P62830 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl23P62830 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl23P62830 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl23P62830 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl23P62830 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl23P62830 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl23P62830 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl23P62830 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl23P62830 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl23P62830 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl23P62830 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl23P62830 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl23P62830 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl23P62830 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl23P62830 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl23P62830 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl23P62830 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl23P62830 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl23P62830 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl23P62830 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl23P62830 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl23P62830 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl23P62830 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl23P62830 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpl23P62830 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl23P62830 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl23P62830 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl23P62830 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl23P62830 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl23P62830 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl23P62830 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl23P62830 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl23P62830 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl23P62830 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl23P62830 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl23P62830 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl23P62830 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl23P62830 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl23P62830 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl23P62830 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl23P62830 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl23P62830 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl23P62830 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl23P62830 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms