Protein–RNA interactions for Protein: P62196

Psmc5, 26S proteasome regulatory subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc5P62196 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Psmc5P62196 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psmc5P62196 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psmc5P62196 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psmc5P62196 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psmc5P62196 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psmc5P62196 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psmc5P62196 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psmc5P62196 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psmc5P62196 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psmc5P62196 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psmc5P62196 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psmc5P62196 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Psmc5P62196 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Psmc5P62196 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Psmc5P62196 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Psmc5P62196 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Psmc5P62196 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Psmc5P62196 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psmc5P62196 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psmc5P62196 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psmc5P62196 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psmc5P62196 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psmc5P62196 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psmc5P62196 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psmc5P62196 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Psmc5P62196 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Psmc5P62196 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Psmc5P62196 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Psmc5P62196 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Psmc5P62196 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Psmc5P62196 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Psmc5P62196 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Psmc5P62196 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psmc5P62196 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psmc5P62196 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psmc5P62196 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psmc5P62196 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psmc5P62196 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psmc5P62196 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psmc5P62196 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psmc5P62196 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psmc5P62196 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psmc5P62196 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Psmc5P62196 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psmc5P62196 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psmc5P62196 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psmc5P62196 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psmc5P62196 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Psmc5P62196 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psmc5P62196 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psmc5P62196 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psmc5P62196 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psmc5P62196 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psmc5P62196 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psmc5P62196 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psmc5P62196 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psmc5P62196 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psmc5P62196 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psmc5P62196 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psmc5P62196 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psmc5P62196 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psmc5P62196 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psmc5P62196 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psmc5P62196 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psmc5P62196 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psmc5P62196 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psmc5P62196 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psmc5P62196 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psmc5P62196 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psmc5P62196 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psmc5P62196 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psmc5P62196 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psmc5P62196 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psmc5P62196 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psmc5P62196 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psmc5P62196 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psmc5P62196 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psmc5P62196 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psmc5P62196 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psmc5P62196 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psmc5P62196 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psmc5P62196 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psmc5P62196 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psmc5P62196 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psmc5P62196 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psmc5P62196 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psmc5P62196 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psmc5P62196 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psmc5P62196 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psmc5P62196 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psmc5P62196 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psmc5P62196 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psmc5P62196 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Psmc5P62196 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Psmc5P62196 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Psmc5P62196 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Psmc5P62196 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Psmc5P62196 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Psmc5P62196 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms