Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmo4P61969 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmo4P61969 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lmo4P61969 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lmo4P61969 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmo4P61969 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmo4P61969 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmo4P61969 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmo4P61969 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmo4P61969 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmo4P61969 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmo4P61969 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmo4P61969 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmo4P61969 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmo4P61969 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmo4P61969 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmo4P61969 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmo4P61969 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmo4P61969 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmo4P61969 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmo4P61969 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmo4P61969 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmo4P61969 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmo4P61969 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmo4P61969 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmo4P61969 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmo4P61969 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmo4P61969 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmo4P61969 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmo4P61969 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmo4P61969 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmo4P61969 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmo4P61969 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmo4P61969 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmo4P61969 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmo4P61969 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmo4P61969 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmo4P61969 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmo4P61969 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmo4P61969 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmo4P61969 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmo4P61969 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmo4P61969 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmo4P61969 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmo4P61969 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmo4P61969 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmo4P61969 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmo4P61969 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmo4P61969 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmo4P61969 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmo4P61969 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmo4P61969 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmo4P61969 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmo4P61969 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmo4P61969 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Lmo4P61969 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmo4P61969 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmo4P61969 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmo4P61969 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmo4P61969 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmo4P61969 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmo4P61969 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmo4P61969 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmo4P61969 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmo4P61969 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmo4P61969 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmo4P61969 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmo4P61969 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmo4P61969 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmo4P61969 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmo4P61969 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmo4P61969 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmo4P61969 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmo4P61969 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmo4P61969 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmo4P61969 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmo4P61969 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmo4P61969 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmo4P61969 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmo4P61969 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmo4P61969 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmo4P61969 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmo4P61969 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmo4P61969 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmo4P61969 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmo4P61969 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmo4P61969 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmo4P61969 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmo4P61969 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmo4P61969 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmo4P61969 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmo4P61969 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmo4P61969 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmo4P61969 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmo4P61969 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmo4P61969 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmo4P61969 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lmo4P61969 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lmo4P61969 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lmo4P61969 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms