Protein–RNA interactions for Protein: P61219

Polr2f, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2fP61219 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Polr2fP61219 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Polr2fP61219 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Polr2fP61219 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Polr2fP61219 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Polr2fP61219 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Polr2fP61219 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr2fP61219 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr2fP61219 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr2fP61219 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr2fP61219 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr2fP61219 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr2fP61219 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr2fP61219 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr2fP61219 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr2fP61219 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr2fP61219 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr2fP61219 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr2fP61219 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr2fP61219 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr2fP61219 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr2fP61219 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr2fP61219 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr2fP61219 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr2fP61219 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr2fP61219 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr2fP61219 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr2fP61219 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr2fP61219 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr2fP61219 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr2fP61219 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr2fP61219 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr2fP61219 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr2fP61219 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr2fP61219 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr2fP61219 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr2fP61219 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr2fP61219 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr2fP61219 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr2fP61219 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr2fP61219 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr2fP61219 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr2fP61219 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr2fP61219 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr2fP61219 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr2fP61219 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr2fP61219 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr2fP61219 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr2fP61219 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr2fP61219 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr2fP61219 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr2fP61219 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr2fP61219 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr2fP61219 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr2fP61219 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr2fP61219 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr2fP61219 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr2fP61219 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Polr2fP61219 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Polr2fP61219 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Polr2fP61219 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Polr2fP61219 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Polr2fP61219 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Polr2fP61219 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr2fP61219 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr2fP61219 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr2fP61219 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr2fP61219 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr2fP61219 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr2fP61219 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr2fP61219 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr2fP61219 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr2fP61219 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr2fP61219 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr2fP61219 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr2fP61219 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr2fP61219 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr2fP61219 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr2fP61219 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr2fP61219 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr2fP61219 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr2fP61219 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr2fP61219 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr2fP61219 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr2fP61219 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr2fP61219 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr2fP61219 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr2fP61219 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr2fP61219 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr2fP61219 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr2fP61219 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr2fP61219 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr2fP61219 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr2fP61219 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr2fP61219 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr2fP61219 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr2fP61219 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr2fP61219 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr2fP61219 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr2fP61219 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms