Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2kP61087 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2kP61087 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2kP61087 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2kP61087 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ube2kP61087 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ube2kP61087 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ube2kP61087 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ube2kP61087 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ube2kP61087 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ube2kP61087 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ube2kP61087 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ube2kP61087 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ube2kP61087 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ube2kP61087 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ube2kP61087 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ube2kP61087 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube2kP61087 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube2kP61087 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube2kP61087 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube2kP61087 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube2kP61087 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube2kP61087 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube2kP61087 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube2kP61087 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube2kP61087 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube2kP61087 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube2kP61087 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ube2kP61087 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ube2kP61087 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ube2kP61087 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ube2kP61087 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ube2kP61087 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ube2kP61087 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ube2kP61087 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ube2kP61087 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ube2kP61087 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ube2kP61087 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ube2kP61087 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ube2kP61087 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ube2kP61087 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ube2kP61087 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ube2kP61087 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ube2kP61087 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ube2kP61087 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ube2kP61087 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ube2kP61087 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ube2kP61087 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ube2kP61087 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ube2kP61087 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ube2kP61087 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ube2kP61087 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ube2kP61087 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ube2kP61087 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ube2kP61087 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ube2kP61087 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ube2kP61087 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2kP61087 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2kP61087 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2kP61087 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2kP61087 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2kP61087 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2kP61087 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2kP61087 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2kP61087 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2kP61087 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2kP61087 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2kP61087 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2kP61087 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2kP61087 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2kP61087 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ube2kP61087 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2kP61087 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2kP61087 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2kP61087 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2kP61087 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2kP61087 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2kP61087 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2kP61087 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2kP61087 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube2kP61087 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube2kP61087 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube2kP61087 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube2kP61087 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube2kP61087 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube2kP61087 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2kP61087 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2kP61087 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2kP61087 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2kP61087 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2kP61087 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2kP61087 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2kP61087 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2kP61087 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2kP61087 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2kP61087 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2kP61087 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2kP61087 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2kP61087 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2kP61087 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms