Protein–RNA interactions for Protein: P61014

Pln, Cardiac phospholamban, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PlnP61014 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PlnP61014 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PlnP61014 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PlnP61014 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PlnP61014 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PlnP61014 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PlnP61014 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PlnP61014 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PlnP61014 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PlnP61014 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PlnP61014 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PlnP61014 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PlnP61014 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PlnP61014 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PlnP61014 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PlnP61014 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PlnP61014 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PlnP61014 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PlnP61014 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PlnP61014 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PlnP61014 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PlnP61014 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PlnP61014 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
PlnP61014 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PlnP61014 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PlnP61014 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PlnP61014 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PlnP61014 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PlnP61014 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PlnP61014 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PlnP61014 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PlnP61014 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PlnP61014 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PlnP61014 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PlnP61014 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PlnP61014 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PlnP61014 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PlnP61014 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PlnP61014 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PlnP61014 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PlnP61014 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PlnP61014 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PlnP61014 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PlnP61014 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PlnP61014 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PlnP61014 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PlnP61014 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PlnP61014 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PlnP61014 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PlnP61014 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PlnP61014 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PlnP61014 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PlnP61014 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PlnP61014 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PlnP61014 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PlnP61014 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PlnP61014 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PlnP61014 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PlnP61014 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PlnP61014 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PlnP61014 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PlnP61014 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PlnP61014 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PlnP61014 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PlnP61014 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PlnP61014 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PlnP61014 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PlnP61014 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PlnP61014 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PlnP61014 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PlnP61014 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PlnP61014 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PlnP61014 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PlnP61014 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PlnP61014 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PlnP61014 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PlnP61014 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PlnP61014 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PlnP61014 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PlnP61014 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PlnP61014 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PlnP61014 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PlnP61014 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PlnP61014 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PlnP61014 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PlnP61014 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PlnP61014 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PlnP61014 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PlnP61014 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PlnP61014 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PlnP61014 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PlnP61014 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PlnP61014 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PlnP61014 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PlnP61014 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PlnP61014 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PlnP61014 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PlnP61014 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PlnP61014 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PlnP61014 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms