Protein–RNA interactions for Protein: P59913

Pcmtd1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcmtd1P59913 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcmtd1P59913 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcmtd1P59913 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcmtd1P59913 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcmtd1P59913 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcmtd1P59913 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcmtd1P59913 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcmtd1P59913 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcmtd1P59913 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcmtd1P59913 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcmtd1P59913 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcmtd1P59913 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcmtd1P59913 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcmtd1P59913 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcmtd1P59913 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcmtd1P59913 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcmtd1P59913 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcmtd1P59913 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcmtd1P59913 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcmtd1P59913 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcmtd1P59913 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcmtd1P59913 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcmtd1P59913 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcmtd1P59913 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pcmtd1P59913 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcmtd1P59913 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcmtd1P59913 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcmtd1P59913 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcmtd1P59913 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcmtd1P59913 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcmtd1P59913 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcmtd1P59913 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcmtd1P59913 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcmtd1P59913 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcmtd1P59913 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcmtd1P59913 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcmtd1P59913 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcmtd1P59913 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcmtd1P59913 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcmtd1P59913 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcmtd1P59913 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcmtd1P59913 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcmtd1P59913 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcmtd1P59913 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcmtd1P59913 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcmtd1P59913 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcmtd1P59913 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcmtd1P59913 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcmtd1P59913 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcmtd1P59913 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcmtd1P59913 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcmtd1P59913 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcmtd1P59913 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcmtd1P59913 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcmtd1P59913 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcmtd1P59913 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcmtd1P59913 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcmtd1P59913 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcmtd1P59913 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcmtd1P59913 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcmtd1P59913 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcmtd1P59913 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcmtd1P59913 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcmtd1P59913 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcmtd1P59913 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcmtd1P59913 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcmtd1P59913 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcmtd1P59913 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcmtd1P59913 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcmtd1P59913 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcmtd1P59913 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcmtd1P59913 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pcmtd1P59913 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pcmtd1P59913 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pcmtd1P59913 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pcmtd1P59913 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pcmtd1P59913 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcmtd1P59913 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcmtd1P59913 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcmtd1P59913 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcmtd1P59913 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcmtd1P59913 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcmtd1P59913 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcmtd1P59913 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcmtd1P59913 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcmtd1P59913 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcmtd1P59913 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcmtd1P59913 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcmtd1P59913 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcmtd1P59913 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcmtd1P59913 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcmtd1P59913 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcmtd1P59913 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcmtd1P59913 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcmtd1P59913 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcmtd1P59913 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcmtd1P59913 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcmtd1P59913 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcmtd1P59913 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcmtd1P59913 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms