Protein–RNA interactions for Protein: P59016

Vps33b, Vacuolar protein sorting-associated protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33bP59016 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Vps33bP59016 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Vps33bP59016 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Vps33bP59016 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Vps33bP59016 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Vps33bP59016 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Vps33bP59016 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Vps33bP59016 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Vps33bP59016 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Vps33bP59016 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Vps33bP59016 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Vps33bP59016 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Vps33bP59016 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Vps33bP59016 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Vps33bP59016 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Vps33bP59016 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Vps33bP59016 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Vps33bP59016 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Vps33bP59016 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Vps33bP59016 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Vps33bP59016 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Vps33bP59016 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Vps33bP59016 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Vps33bP59016 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Vps33bP59016 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Vps33bP59016 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Vps33bP59016 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Vps33bP59016 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Vps33bP59016 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Vps33bP59016 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Vps33bP59016 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Vps33bP59016 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Vps33bP59016 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Vps33bP59016 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Vps33bP59016 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Vps33bP59016 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Vps33bP59016 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Vps33bP59016 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Vps33bP59016 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Vps33bP59016 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Vps33bP59016 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Vps33bP59016 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Vps33bP59016 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Vps33bP59016 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Vps33bP59016 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Vps33bP59016 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Vps33bP59016 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Vps33bP59016 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Vps33bP59016 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Vps33bP59016 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Vps33bP59016 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Vps33bP59016 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Vps33bP59016 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Vps33bP59016 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Vps33bP59016 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Vps33bP59016 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Vps33bP59016 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Vps33bP59016 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Vps33bP59016 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Vps33bP59016 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Vps33bP59016 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Vps33bP59016 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Vps33bP59016 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Vps33bP59016 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Vps33bP59016 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Vps33bP59016 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Vps33bP59016 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Vps33bP59016 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Vps33bP59016 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Vps33bP59016 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Vps33bP59016 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Vps33bP59016 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Vps33bP59016 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Vps33bP59016 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Vps33bP59016 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Vps33bP59016 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
Vps33bP59016 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Vps33bP59016 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Vps33bP59016 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Vps33bP59016 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Vps33bP59016 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Vps33bP59016 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Vps33bP59016 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Vps33bP59016 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Vps33bP59016 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Vps33bP59016 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Vps33bP59016 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Vps33bP59016 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Vps33bP59016 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Vps33bP59016 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Vps33bP59016 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Vps33bP59016 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Vps33bP59016 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Vps33bP59016 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Vps33bP59016 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Vps33bP59016 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Vps33bP59016 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Vps33bP59016 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Vps33bP59016 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Vps33bP59016 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms