Protein–RNA interactions for Protein: P58749

Tm6sf1, Transmembrane 6 superfamily member 1, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm6sf1P58749 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tm6sf1P58749 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tm6sf1P58749 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tm6sf1P58749 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tm6sf1P58749 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tm6sf1P58749 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tm6sf1P58749 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tm6sf1P58749 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tm6sf1P58749 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tm6sf1P58749 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tm6sf1P58749 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tm6sf1P58749 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Tm6sf1P58749 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tm6sf1P58749 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tm6sf1P58749 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tm6sf1P58749 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tm6sf1P58749 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tm6sf1P58749 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tm6sf1P58749 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tm6sf1P58749 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Tm6sf1P58749 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tm6sf1P58749 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tm6sf1P58749 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tm6sf1P58749 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tm6sf1P58749 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tm6sf1P58749 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tm6sf1P58749 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tm6sf1P58749 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tm6sf1P58749 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tm6sf1P58749 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Tm6sf1P58749 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tm6sf1P58749 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tm6sf1P58749 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tm6sf1P58749 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Tm6sf1P58749 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tm6sf1P58749 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tm6sf1P58749 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tm6sf1P58749 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tm6sf1P58749 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tm6sf1P58749 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tm6sf1P58749 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tm6sf1P58749 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tm6sf1P58749 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tm6sf1P58749 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tm6sf1P58749 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tm6sf1P58749 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tm6sf1P58749 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tm6sf1P58749 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tm6sf1P58749 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tm6sf1P58749 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tm6sf1P58749 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tm6sf1P58749 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tm6sf1P58749 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tm6sf1P58749 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tm6sf1P58749 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tm6sf1P58749 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tm6sf1P58749 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tm6sf1P58749 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tm6sf1P58749 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tm6sf1P58749 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tm6sf1P58749 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tm6sf1P58749 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tm6sf1P58749 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tm6sf1P58749 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tm6sf1P58749 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tm6sf1P58749 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Tm6sf1P58749 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tm6sf1P58749 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tm6sf1P58749 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tm6sf1P58749 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tm6sf1P58749 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tm6sf1P58749 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tm6sf1P58749 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tm6sf1P58749 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Tm6sf1P58749 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tm6sf1P58749 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tm6sf1P58749 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tm6sf1P58749 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tm6sf1P58749 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tm6sf1P58749 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tm6sf1P58749 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tm6sf1P58749 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tm6sf1P58749 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tm6sf1P58749 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tm6sf1P58749 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tm6sf1P58749 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tm6sf1P58749 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tm6sf1P58749 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tm6sf1P58749 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tm6sf1P58749 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Tm6sf1P58749 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tm6sf1P58749 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tm6sf1P58749 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tm6sf1P58749 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tm6sf1P58749 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tm6sf1P58749 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tm6sf1P58749 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tm6sf1P58749 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Tm6sf1P58749 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tm6sf1P58749 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms