Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Setd4P58467 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Setd4P58467 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Setd4P58467 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Setd4P58467 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Setd4P58467 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Setd4P58467 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Setd4P58467 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Setd4P58467 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Setd4P58467 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Setd4P58467 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Setd4P58467 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Setd4P58467 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Setd4P58467 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Setd4P58467 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Setd4P58467 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Setd4P58467 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Setd4P58467 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Setd4P58467 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Setd4P58467 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Setd4P58467 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Setd4P58467 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Setd4P58467 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Setd4P58467 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Setd4P58467 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Setd4P58467 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Setd4P58467 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Setd4P58467 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Setd4P58467 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Setd4P58467 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Setd4P58467 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Setd4P58467 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Setd4P58467 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Setd4P58467 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Setd4P58467 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Setd4P58467 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Setd4P58467 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Setd4P58467 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Setd4P58467 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Setd4P58467 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Setd4P58467 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Setd4P58467 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Setd4P58467 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Setd4P58467 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Setd4P58467 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Setd4P58467 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Setd4P58467 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Setd4P58467 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Setd4P58467 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Setd4P58467 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Setd4P58467 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Setd4P58467 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Setd4P58467 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Setd4P58467 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Setd4P58467 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Setd4P58467 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Setd4P58467 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Setd4P58467 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Setd4P58467 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Setd4P58467 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Setd4P58467 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Setd4P58467 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Setd4P58467 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Setd4P58467 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Setd4P58467 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Setd4P58467 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Setd4P58467 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Setd4P58467 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Setd4P58467 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Setd4P58467 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Setd4P58467 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Setd4P58467 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Setd4P58467 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Setd4P58467 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Setd4P58467 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Setd4P58467 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Setd4P58467 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Setd4P58467 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Setd4P58467 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Setd4P58467 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Setd4P58467 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Setd4P58467 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Setd4P58467 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Setd4P58467 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Setd4P58467 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Setd4P58467 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Setd4P58467 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Setd4P58467 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Setd4P58467 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Setd4P58467 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Setd4P58467 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Setd4P58467 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Setd4P58467 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Setd4P58467 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Setd4P58467 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Setd4P58467 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Setd4P58467 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Setd4P58467 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Setd4P58467 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Setd4P58467 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.6 ms