Protein–RNA interactions for Protein: P57780

Actn4, Alpha-actinin-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn4P57780 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Actn4P57780 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Actn4P57780 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Actn4P57780 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Actn4P57780 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Actn4P57780 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Actn4P57780 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Actn4P57780 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Actn4P57780 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Actn4P57780 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Actn4P57780 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Actn4P57780 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Actn4P57780 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Actn4P57780 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Actn4P57780 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Actn4P57780 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Actn4P57780 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Actn4P57780 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Actn4P57780 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Actn4P57780 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Actn4P57780 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Actn4P57780 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Actn4P57780 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Actn4P57780 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Actn4P57780 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Actn4P57780 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Actn4P57780 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Actn4P57780 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Actn4P57780 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Actn4P57780 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Actn4P57780 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Actn4P57780 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Actn4P57780 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Actn4P57780 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Actn4P57780 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Actn4P57780 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Actn4P57780 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Actn4P57780 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Actn4P57780 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Actn4P57780 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Actn4P57780 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Actn4P57780 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Actn4P57780 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Actn4P57780 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Actn4P57780 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Actn4P57780 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Actn4P57780 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Actn4P57780 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Actn4P57780 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Actn4P57780 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Actn4P57780 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Actn4P57780 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Actn4P57780 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Actn4P57780 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Actn4P57780 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Actn4P57780 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Actn4P57780 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Actn4P57780 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Actn4P57780 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Actn4P57780 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Actn4P57780 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Actn4P57780 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Actn4P57780 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Actn4P57780 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Actn4P57780 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Actn4P57780 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Actn4P57780 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Actn4P57780 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Actn4P57780 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Actn4P57780 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Actn4P57780 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Actn4P57780 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Actn4P57780 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Actn4P57780 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Actn4P57780 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Actn4P57780 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Actn4P57780 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Actn4P57780 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Actn4P57780 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Actn4P57780 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Actn4P57780 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Actn4P57780 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Actn4P57780 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Actn4P57780 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Actn4P57780 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Actn4P57780 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Actn4P57780 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Actn4P57780 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Actn4P57780 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Actn4P57780 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Actn4P57780 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Actn4P57780 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Actn4P57780 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Actn4P57780 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Actn4P57780 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Actn4P57780 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Actn4P57780 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Actn4P57780 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Actn4P57780 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Actn4P57780 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms