Protein–RNA interactions for Protein: P56371

Rab4a, Ras-related protein Rab-4A, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab4aP56371 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab4aP56371 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab4aP56371 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab4aP56371 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab4aP56371 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab4aP56371 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab4aP56371 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab4aP56371 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab4aP56371 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab4aP56371 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab4aP56371 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab4aP56371 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab4aP56371 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab4aP56371 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab4aP56371 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab4aP56371 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab4aP56371 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab4aP56371 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab4aP56371 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab4aP56371 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab4aP56371 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab4aP56371 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab4aP56371 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab4aP56371 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab4aP56371 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab4aP56371 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab4aP56371 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab4aP56371 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab4aP56371 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab4aP56371 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab4aP56371 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab4aP56371 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab4aP56371 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab4aP56371 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab4aP56371 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab4aP56371 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab4aP56371 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab4aP56371 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab4aP56371 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab4aP56371 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab4aP56371 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab4aP56371 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab4aP56371 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab4aP56371 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab4aP56371 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab4aP56371 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab4aP56371 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab4aP56371 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab4aP56371 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab4aP56371 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab4aP56371 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab4aP56371 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab4aP56371 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab4aP56371 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab4aP56371 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab4aP56371 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab4aP56371 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab4aP56371 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab4aP56371 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab4aP56371 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab4aP56371 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab4aP56371 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab4aP56371 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab4aP56371 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab4aP56371 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab4aP56371 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab4aP56371 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab4aP56371 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab4aP56371 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab4aP56371 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab4aP56371 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab4aP56371 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab4aP56371 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab4aP56371 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab4aP56371 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rab4aP56371 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rab4aP56371 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab4aP56371 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab4aP56371 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab4aP56371 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab4aP56371 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab4aP56371 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab4aP56371 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab4aP56371 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab4aP56371 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab4aP56371 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab4aP56371 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab4aP56371 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab4aP56371 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab4aP56371 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab4aP56371 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab4aP56371 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab4aP56371 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab4aP56371 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab4aP56371 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab4aP56371 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab4aP56371 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab4aP56371 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab4aP56371 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab4aP56371 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms