Protein–RNA interactions for Protein: P54830

Ptpn5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn5P54830 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ptpn5P54830 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ptpn5P54830 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ptpn5P54830 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ptpn5P54830 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ptpn5P54830 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ptpn5P54830 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ptpn5P54830 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ptpn5P54830 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ptpn5P54830 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ptpn5P54830 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ptpn5P54830 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ptpn5P54830 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ptpn5P54830 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ptpn5P54830 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ptpn5P54830 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ptpn5P54830 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ptpn5P54830 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ptpn5P54830 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ptpn5P54830 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ptpn5P54830 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ptpn5P54830 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ptpn5P54830 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ptpn5P54830 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ptpn5P54830 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ptpn5P54830 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ptpn5P54830 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ptpn5P54830 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ptpn5P54830 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ptpn5P54830 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ptpn5P54830 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ptpn5P54830 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptpn5P54830 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptpn5P54830 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptpn5P54830 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptpn5P54830 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptpn5P54830 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptpn5P54830 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptpn5P54830 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ptpn5P54830 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ptpn5P54830 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ptpn5P54830 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ptpn5P54830 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ptpn5P54830 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ptpn5P54830 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ptpn5P54830 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ptpn5P54830 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptpn5P54830 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptpn5P54830 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptpn5P54830 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptpn5P54830 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptpn5P54830 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptpn5P54830 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptpn5P54830 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptpn5P54830 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptpn5P54830 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptpn5P54830 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptpn5P54830 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptpn5P54830 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptpn5P54830 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptpn5P54830 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptpn5P54830 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptpn5P54830 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptpn5P54830 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptpn5P54830 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptpn5P54830 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptpn5P54830 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptpn5P54830 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptpn5P54830 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptpn5P54830 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptpn5P54830 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptpn5P54830 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptpn5P54830 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptpn5P54830 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptpn5P54830 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptpn5P54830 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptpn5P54830 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptpn5P54830 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptpn5P54830 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptpn5P54830 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptpn5P54830 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptpn5P54830 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptpn5P54830 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptpn5P54830 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptpn5P54830 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptpn5P54830 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptpn5P54830 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptpn5P54830 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptpn5P54830 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptpn5P54830 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptpn5P54830 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptpn5P54830 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptpn5P54830 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptpn5P54830 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptpn5P54830 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptpn5P54830 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptpn5P54830 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ptpn5P54830 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptpn5P54830 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptpn5P54830 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms