Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PctpP53808 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PctpP53808 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PctpP53808 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PctpP53808 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PctpP53808 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PctpP53808 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PctpP53808 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PctpP53808 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PctpP53808 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PctpP53808 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PctpP53808 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PctpP53808 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PctpP53808 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PctpP53808 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PctpP53808 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PctpP53808 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PctpP53808 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PctpP53808 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PctpP53808 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PctpP53808 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PctpP53808 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PctpP53808 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PctpP53808 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PctpP53808 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PctpP53808 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PctpP53808 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PctpP53808 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PctpP53808 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PctpP53808 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PctpP53808 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PctpP53808 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PctpP53808 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PctpP53808 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PctpP53808 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PctpP53808 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PctpP53808 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PctpP53808 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PctpP53808 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PctpP53808 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PctpP53808 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PctpP53808 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PctpP53808 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PctpP53808 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PctpP53808 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PctpP53808 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PctpP53808 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PctpP53808 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PctpP53808 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PctpP53808 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PctpP53808 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PctpP53808 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PctpP53808 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PctpP53808 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PctpP53808 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PctpP53808 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PctpP53808 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PctpP53808 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PctpP53808 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PctpP53808 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PctpP53808 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PctpP53808 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PctpP53808 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PctpP53808 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PctpP53808 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PctpP53808 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PctpP53808 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PctpP53808 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PctpP53808 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PctpP53808 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PctpP53808 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PctpP53808 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PctpP53808 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PctpP53808 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PctpP53808 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PctpP53808 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PctpP53808 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PctpP53808 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PctpP53808 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PctpP53808 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PctpP53808 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PctpP53808 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PctpP53808 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PctpP53808 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PctpP53808 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PctpP53808 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PctpP53808 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PctpP53808 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PctpP53808 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PctpP53808 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PctpP53808 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PctpP53808 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PctpP53808 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PctpP53808 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PctpP53808 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PctpP53808 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PctpP53808 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PctpP53808 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PctpP53808 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PctpP53808 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 185.7 ms