Protein–RNA interactions for Protein: P53566

Cebpa, CCAAT/enhancer-binding protein alpha, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpaP53566 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CebpaP53566 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CebpaP53566 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CebpaP53566 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CebpaP53566 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CebpaP53566 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CebpaP53566 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CebpaP53566 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CebpaP53566 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CebpaP53566 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CebpaP53566 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CebpaP53566 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CebpaP53566 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CebpaP53566 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CebpaP53566 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CebpaP53566 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CebpaP53566 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CebpaP53566 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CebpaP53566 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CebpaP53566 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CebpaP53566 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CebpaP53566 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CebpaP53566 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CebpaP53566 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CebpaP53566 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CebpaP53566 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CebpaP53566 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CebpaP53566 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CebpaP53566 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CebpaP53566 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CebpaP53566 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CebpaP53566 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CebpaP53566 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CebpaP53566 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CebpaP53566 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CebpaP53566 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CebpaP53566 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CebpaP53566 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CebpaP53566 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CebpaP53566 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CebpaP53566 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CebpaP53566 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CebpaP53566 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CebpaP53566 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CebpaP53566 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CebpaP53566 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CebpaP53566 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CebpaP53566 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CebpaP53566 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CebpaP53566 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CebpaP53566 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CebpaP53566 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CebpaP53566 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CebpaP53566 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CebpaP53566 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CebpaP53566 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CebpaP53566 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CebpaP53566 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CebpaP53566 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CebpaP53566 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CebpaP53566 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CebpaP53566 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CebpaP53566 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CebpaP53566 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CebpaP53566 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CebpaP53566 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CebpaP53566 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CebpaP53566 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CebpaP53566 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CebpaP53566 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CebpaP53566 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CebpaP53566 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CebpaP53566 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CebpaP53566 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CebpaP53566 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CebpaP53566 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CebpaP53566 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CebpaP53566 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CebpaP53566 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CebpaP53566 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CebpaP53566 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CebpaP53566 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CebpaP53566 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CebpaP53566 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CebpaP53566 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CebpaP53566 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CebpaP53566 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CebpaP53566 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CebpaP53566 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CebpaP53566 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CebpaP53566 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CebpaP53566 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CebpaP53566 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CebpaP53566 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CebpaP53566 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CebpaP53566 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CebpaP53566 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CebpaP53566 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CebpaP53566 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CebpaP53566 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms