Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Efnb1P52795 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Efnb1P52795 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Efnb1P52795 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Efnb1P52795 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Efnb1P52795 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Efnb1P52795 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Efnb1P52795 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Efnb1P52795 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Efnb1P52795 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Efnb1P52795 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Efnb1P52795 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Efnb1P52795 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Efnb1P52795 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Efnb1P52795 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Efnb1P52795 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Efnb1P52795 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Efnb1P52795 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Efnb1P52795 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Efnb1P52795 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Efnb1P52795 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Efnb1P52795 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Efnb1P52795 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Efnb1P52795 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Efnb1P52795 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Efnb1P52795 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Efnb1P52795 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Efnb1P52795 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Efnb1P52795 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Efnb1P52795 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Efnb1P52795 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Efnb1P52795 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Efnb1P52795 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Efnb1P52795 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Efnb1P52795 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Efnb1P52795 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Efnb1P52795 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Efnb1P52795 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Efnb1P52795 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Efnb1P52795 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Efnb1P52795 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Efnb1P52795 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Efnb1P52795 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Efnb1P52795 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Efnb1P52795 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Efnb1P52795 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Efnb1P52795 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Efnb1P52795 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Efnb1P52795 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Efnb1P52795 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Efnb1P52795 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Efnb1P52795 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Efnb1P52795 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Efnb1P52795 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Efnb1P52795 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Efnb1P52795 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Efnb1P52795 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Efnb1P52795 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Efnb1P52795 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Efnb1P52795 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Efnb1P52795 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Efnb1P52795 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Efnb1P52795 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Efnb1P52795 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Efnb1P52795 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Efnb1P52795 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Efnb1P52795 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Efnb1P52795 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Efnb1P52795 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Efnb1P52795 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Efnb1P52795 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Efnb1P52795 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Efnb1P52795 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Efnb1P52795 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Efnb1P52795 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Efnb1P52795 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Efnb1P52795 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Efnb1P52795 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Efnb1P52795 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Efnb1P52795 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Efnb1P52795 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Efnb1P52795 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Efnb1P52795 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Efnb1P52795 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Efnb1P52795 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Efnb1P52795 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Efnb1P52795 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Efnb1P52795 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Efnb1P52795 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Efnb1P52795 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Efnb1P52795 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Efnb1P52795 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Efnb1P52795 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Efnb1P52795 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Efnb1P52795 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Efnb1P52795 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Efnb1P52795 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Efnb1P52795 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Efnb1P52795 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Efnb1P52795 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms