Protein–RNA interactions for Protein: P52482

Ube2e1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e1P52482 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ube2e1P52482 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ube2e1P52482 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ube2e1P52482 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ube2e1P52482 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ube2e1P52482 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ube2e1P52482 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ube2e1P52482 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ube2e1P52482 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ube2e1P52482 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ube2e1P52482 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ube2e1P52482 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ube2e1P52482 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ube2e1P52482 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ube2e1P52482 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ube2e1P52482 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ube2e1P52482 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ube2e1P52482 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ube2e1P52482 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ube2e1P52482 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ube2e1P52482 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ube2e1P52482 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ube2e1P52482 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ube2e1P52482 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ube2e1P52482 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ube2e1P52482 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ube2e1P52482 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ube2e1P52482 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ube2e1P52482 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ube2e1P52482 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ube2e1P52482 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ube2e1P52482 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ube2e1P52482 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ube2e1P52482 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ube2e1P52482 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ube2e1P52482 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ube2e1P52482 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ube2e1P52482 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ube2e1P52482 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ube2e1P52482 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ube2e1P52482 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ube2e1P52482 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ube2e1P52482 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ube2e1P52482 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ube2e1P52482 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ube2e1P52482 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ube2e1P52482 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ube2e1P52482 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ube2e1P52482 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ube2e1P52482 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ube2e1P52482 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ube2e1P52482 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ube2e1P52482 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ube2e1P52482 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ube2e1P52482 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ube2e1P52482 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ube2e1P52482 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ube2e1P52482 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ube2e1P52482 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ube2e1P52482 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ube2e1P52482 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ube2e1P52482 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ube2e1P52482 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ube2e1P52482 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ube2e1P52482 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ube2e1P52482 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ube2e1P52482 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ube2e1P52482 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ube2e1P52482 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ube2e1P52482 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ube2e1P52482 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ube2e1P52482 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ube2e1P52482 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ube2e1P52482 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ube2e1P52482 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ube2e1P52482 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ube2e1P52482 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ube2e1P52482 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ube2e1P52482 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ube2e1P52482 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ube2e1P52482 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ube2e1P52482 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ube2e1P52482 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ube2e1P52482 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ube2e1P52482 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ube2e1P52482 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ube2e1P52482 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ube2e1P52482 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ube2e1P52482 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ube2e1P52482 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ube2e1P52482 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ube2e1P52482 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ube2e1P52482 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ube2e1P52482 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ube2e1P52482 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ube2e1P52482 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ube2e1P52482 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ube2e1P52482 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ube2e1P52482 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ube2e1P52482 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms