Protein–RNA interactions for Protein: P51910

Apod, Apolipoprotein D, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApodP51910 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ApodP51910 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ApodP51910 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ApodP51910 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ApodP51910 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ApodP51910 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ApodP51910 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ApodP51910 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ApodP51910 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ApodP51910 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ApodP51910 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ApodP51910 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ApodP51910 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ApodP51910 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ApodP51910 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ApodP51910 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ApodP51910 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ApodP51910 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ApodP51910 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ApodP51910 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ApodP51910 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ApodP51910 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ApodP51910 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ApodP51910 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ApodP51910 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ApodP51910 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ApodP51910 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ApodP51910 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ApodP51910 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ApodP51910 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ApodP51910 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ApodP51910 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ApodP51910 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ApodP51910 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ApodP51910 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ApodP51910 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ApodP51910 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ApodP51910 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ApodP51910 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ApodP51910 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ApodP51910 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ApodP51910 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ApodP51910 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ApodP51910 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ApodP51910 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ApodP51910 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ApodP51910 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ApodP51910 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ApodP51910 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ApodP51910 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ApodP51910 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ApodP51910 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ApodP51910 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ApodP51910 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ApodP51910 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ApodP51910 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ApodP51910 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ApodP51910 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ApodP51910 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ApodP51910 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ApodP51910 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ApodP51910 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ApodP51910 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ApodP51910 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ApodP51910 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ApodP51910 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ApodP51910 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ApodP51910 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ApodP51910 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ApodP51910 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ApodP51910 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ApodP51910 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ApodP51910 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ApodP51910 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ApodP51910 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ApodP51910 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ApodP51910 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ApodP51910 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ApodP51910 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ApodP51910 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ApodP51910 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ApodP51910 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ApodP51910 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ApodP51910 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ApodP51910 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ApodP51910 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ApodP51910 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ApodP51910 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ApodP51910 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ApodP51910 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ApodP51910 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ApodP51910 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ApodP51910 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ApodP51910 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ApodP51910 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ApodP51910 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ApodP51910 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ApodP51910 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ApodP51910 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ApodP51910 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms