Protein–RNA interactions for Protein: P51791

Clcn3, H(+)/Cl(-) exchange transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn3P51791 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Clcn3P51791 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clcn3P51791 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clcn3P51791 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Clcn3P51791 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clcn3P51791 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clcn3P51791 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clcn3P51791 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clcn3P51791 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clcn3P51791 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clcn3P51791 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clcn3P51791 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clcn3P51791 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clcn3P51791 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clcn3P51791 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clcn3P51791 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Clcn3P51791 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clcn3P51791 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Clcn3P51791 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Clcn3P51791 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clcn3P51791 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clcn3P51791 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clcn3P51791 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clcn3P51791 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clcn3P51791 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clcn3P51791 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clcn3P51791 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clcn3P51791 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clcn3P51791 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clcn3P51791 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clcn3P51791 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clcn3P51791 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Clcn3P51791 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clcn3P51791 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clcn3P51791 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clcn3P51791 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clcn3P51791 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clcn3P51791 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clcn3P51791 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clcn3P51791 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clcn3P51791 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clcn3P51791 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clcn3P51791 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clcn3P51791 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clcn3P51791 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clcn3P51791 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clcn3P51791 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clcn3P51791 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clcn3P51791 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clcn3P51791 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clcn3P51791 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clcn3P51791 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clcn3P51791 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clcn3P51791 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clcn3P51791 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Clcn3P51791 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clcn3P51791 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clcn3P51791 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clcn3P51791 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clcn3P51791 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clcn3P51791 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clcn3P51791 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clcn3P51791 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clcn3P51791 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clcn3P51791 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clcn3P51791 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clcn3P51791 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clcn3P51791 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clcn3P51791 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clcn3P51791 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clcn3P51791 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clcn3P51791 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clcn3P51791 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clcn3P51791 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clcn3P51791 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clcn3P51791 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Clcn3P51791 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clcn3P51791 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clcn3P51791 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clcn3P51791 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clcn3P51791 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Clcn3P51791 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clcn3P51791 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clcn3P51791 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clcn3P51791 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clcn3P51791 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clcn3P51791 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clcn3P51791 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clcn3P51791 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clcn3P51791 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clcn3P51791 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Clcn3P51791 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clcn3P51791 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Clcn3P51791 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clcn3P51791 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Clcn3P51791 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clcn3P51791 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clcn3P51791 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clcn3P51791 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clcn3P51791 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms