Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Defa6P50704 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Defa6P50704 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Defa6P50704 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Defa6P50704 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Defa6P50704 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Defa6P50704 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Defa6P50704 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Defa6P50704 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Defa6P50704 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Defa6P50704 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Defa6P50704 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Defa6P50704 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Defa6P50704 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Defa6P50704 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Defa6P50704 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Defa6P50704 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Defa6P50704 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Defa6P50704 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Defa6P50704 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Defa6P50704 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Defa6P50704 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Defa6P50704 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Defa6P50704 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Defa6P50704 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Defa6P50704 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Defa6P50704 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Defa6P50704 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Defa6P50704 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Defa6P50704 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Defa6P50704 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Defa6P50704 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Defa6P50704 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa6P50704 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa6P50704 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa6P50704 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa6P50704 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa6P50704 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa6P50704 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa6P50704 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa6P50704 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa6P50704 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa6P50704 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa6P50704 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa6P50704 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Defa6P50704 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa6P50704 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa6P50704 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa6P50704 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa6P50704 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa6P50704 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa6P50704 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa6P50704 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa6P50704 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa6P50704 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa6P50704 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa6P50704 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa6P50704 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa6P50704 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa6P50704 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa6P50704 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa6P50704 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa6P50704 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa6P50704 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa6P50704 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa6P50704 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa6P50704 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa6P50704 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa6P50704 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa6P50704 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa6P50704 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa6P50704 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa6P50704 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa6P50704 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa6P50704 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa6P50704 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa6P50704 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa6P50704 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa6P50704 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa6P50704 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa6P50704 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa6P50704 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa6P50704 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa6P50704 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa6P50704 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa6P50704 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa6P50704 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa6P50704 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa6P50704 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa6P50704 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa6P50704 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa6P50704 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa6P50704 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa6P50704 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa6P50704 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa6P50704 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa6P50704 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa6P50704 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa6P50704 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa6P50704 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms