Protein–RNA interactions for Protein: P50586

Tub, Tubby protein, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TubP50586 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TubP50586 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TubP50586 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TubP50586 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TubP50586 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TubP50586 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TubP50586 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TubP50586 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TubP50586 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TubP50586 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TubP50586 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TubP50586 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TubP50586 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TubP50586 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TubP50586 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TubP50586 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TubP50586 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TubP50586 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TubP50586 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TubP50586 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TubP50586 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TubP50586 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TubP50586 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TubP50586 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TubP50586 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TubP50586 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TubP50586 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TubP50586 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TubP50586 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TubP50586 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TubP50586 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TubP50586 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TubP50586 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TubP50586 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TubP50586 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TubP50586 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TubP50586 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TubP50586 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TubP50586 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TubP50586 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TubP50586 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TubP50586 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TubP50586 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TubP50586 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TubP50586 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TubP50586 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TubP50586 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TubP50586 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TubP50586 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TubP50586 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TubP50586 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TubP50586 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TubP50586 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TubP50586 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TubP50586 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TubP50586 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TubP50586 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TubP50586 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TubP50586 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TubP50586 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TubP50586 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TubP50586 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TubP50586 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TubP50586 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TubP50586 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TubP50586 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TubP50586 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TubP50586 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TubP50586 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TubP50586 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TubP50586 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TubP50586 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TubP50586 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TubP50586 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TubP50586 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TubP50586 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TubP50586 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TubP50586 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TubP50586 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TubP50586 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TubP50586 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TubP50586 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TubP50586 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TubP50586 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TubP50586 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TubP50586 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TubP50586 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TubP50586 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TubP50586 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TubP50586 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TubP50586 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TubP50586 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TubP50586 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TubP50586 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TubP50586 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TubP50586 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TubP50586 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TubP50586 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TubP50586 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TubP50586 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms