Protein–RNA interactions for Protein: P49919

Cdkn1c, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1C, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1cP49919 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdkn1cP49919 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdkn1cP49919 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdkn1cP49919 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdkn1cP49919 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdkn1cP49919 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdkn1cP49919 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdkn1cP49919 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdkn1cP49919 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdkn1cP49919 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdkn1cP49919 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdkn1cP49919 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdkn1cP49919 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdkn1cP49919 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdkn1cP49919 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdkn1cP49919 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdkn1cP49919 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdkn1cP49919 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdkn1cP49919 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdkn1cP49919 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdkn1cP49919 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdkn1cP49919 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdkn1cP49919 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdkn1cP49919 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdkn1cP49919 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdkn1cP49919 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdkn1cP49919 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdkn1cP49919 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdkn1cP49919 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdkn1cP49919 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdkn1cP49919 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdkn1cP49919 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cdkn1cP49919 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cdkn1cP49919 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cdkn1cP49919 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cdkn1cP49919 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdkn1cP49919 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdkn1cP49919 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdkn1cP49919 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdkn1cP49919 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdkn1cP49919 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdkn1cP49919 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdkn1cP49919 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdkn1cP49919 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdkn1cP49919 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdkn1cP49919 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdkn1cP49919 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdkn1cP49919 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdkn1cP49919 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdkn1cP49919 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdkn1cP49919 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdkn1cP49919 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdkn1cP49919 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdkn1cP49919 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdkn1cP49919 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdkn1cP49919 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdkn1cP49919 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdkn1cP49919 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdkn1cP49919 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdkn1cP49919 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdkn1cP49919 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdkn1cP49919 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdkn1cP49919 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdkn1cP49919 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdkn1cP49919 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdkn1cP49919 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdkn1cP49919 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdkn1cP49919 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdkn1cP49919 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cdkn1cP49919 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cdkn1cP49919 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cdkn1cP49919 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Cdkn1cP49919 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Cdkn1cP49919 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cdkn1cP49919 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cdkn1cP49919 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cdkn1cP49919 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cdkn1cP49919 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cdkn1cP49919 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdkn1cP49919 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdkn1cP49919 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdkn1cP49919 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdkn1cP49919 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdkn1cP49919 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdkn1cP49919 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdkn1cP49919 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdkn1cP49919 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdkn1cP49919 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdkn1cP49919 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdkn1cP49919 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdkn1cP49919 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdkn1cP49919 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdkn1cP49919 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdkn1cP49919 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdkn1cP49919 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdkn1cP49919 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdkn1cP49919 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdkn1cP49919 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdkn1cP49919 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdkn1cP49919 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms