Protein–RNA interactions for Protein: P49766

Vegfb, Vascular endothelial growth factor B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfbP49766 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VegfbP49766 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VegfbP49766 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VegfbP49766 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VegfbP49766 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VegfbP49766 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VegfbP49766 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VegfbP49766 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VegfbP49766 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VegfbP49766 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VegfbP49766 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VegfbP49766 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VegfbP49766 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VegfbP49766 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
VegfbP49766 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
VegfbP49766 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VegfbP49766 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VegfbP49766 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VegfbP49766 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VegfbP49766 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VegfbP49766 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VegfbP49766 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VegfbP49766 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VegfbP49766 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VegfbP49766 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VegfbP49766 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VegfbP49766 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VegfbP49766 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VegfbP49766 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VegfbP49766 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VegfbP49766 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VegfbP49766 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VegfbP49766 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VegfbP49766 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VegfbP49766 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
VegfbP49766 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VegfbP49766 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VegfbP49766 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VegfbP49766 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VegfbP49766 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VegfbP49766 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VegfbP49766 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VegfbP49766 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VegfbP49766 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VegfbP49766 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VegfbP49766 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
VegfbP49766 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
VegfbP49766 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VegfbP49766 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VegfbP49766 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
VegfbP49766 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VegfbP49766 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VegfbP49766 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VegfbP49766 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
VegfbP49766 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VegfbP49766 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VegfbP49766 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VegfbP49766 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VegfbP49766 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VegfbP49766 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VegfbP49766 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VegfbP49766 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VegfbP49766 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
VegfbP49766 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VegfbP49766 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VegfbP49766 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VegfbP49766 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VegfbP49766 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
VegfbP49766 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
VegfbP49766 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VegfbP49766 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VegfbP49766 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
VegfbP49766 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VegfbP49766 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VegfbP49766 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VegfbP49766 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VegfbP49766 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VegfbP49766 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VegfbP49766 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VegfbP49766 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VegfbP49766 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VegfbP49766 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VegfbP49766 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VegfbP49766 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VegfbP49766 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VegfbP49766 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
VegfbP49766 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VegfbP49766 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
VegfbP49766 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VegfbP49766 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
VegfbP49766 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VegfbP49766 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VegfbP49766 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VegfbP49766 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VegfbP49766 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VegfbP49766 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VegfbP49766 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VegfbP49766 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VegfbP49766 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VegfbP49766 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms