Protein–RNA interactions for Protein: P49615

Cdk5, Cyclin-dependent-like kinase 5, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5P49615 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdk5P49615 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Cdk5P49615 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdk5P49615 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cdk5P49615 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdk5P49615 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdk5P49615 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdk5P49615 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdk5P49615 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdk5P49615 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdk5P49615 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdk5P49615 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdk5P49615 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdk5P49615 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdk5P49615 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdk5P49615 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdk5P49615 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdk5P49615 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdk5P49615 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdk5P49615 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdk5P49615 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdk5P49615 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdk5P49615 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdk5P49615 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdk5P49615 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdk5P49615 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdk5P49615 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdk5P49615 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdk5P49615 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdk5P49615 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdk5P49615 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdk5P49615 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdk5P49615 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdk5P49615 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdk5P49615 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdk5P49615 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdk5P49615 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdk5P49615 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdk5P49615 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdk5P49615 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdk5P49615 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdk5P49615 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdk5P49615 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdk5P49615 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdk5P49615 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdk5P49615 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdk5P49615 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdk5P49615 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdk5P49615 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdk5P49615 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdk5P49615 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdk5P49615 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdk5P49615 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdk5P49615 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdk5P49615 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdk5P49615 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdk5P49615 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdk5P49615 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdk5P49615 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdk5P49615 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdk5P49615 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdk5P49615 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdk5P49615 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdk5P49615 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdk5P49615 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdk5P49615 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdk5P49615 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdk5P49615 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdk5P49615 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdk5P49615 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdk5P49615 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdk5P49615 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdk5P49615 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdk5P49615 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdk5P49615 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdk5P49615 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdk5P49615 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdk5P49615 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdk5P49615 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdk5P49615 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdk5P49615 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdk5P49615 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdk5P49615 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdk5P49615 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdk5P49615 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdk5P49615 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdk5P49615 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdk5P49615 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdk5P49615 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdk5P49615 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdk5P49615 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdk5P49615 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdk5P49615 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdk5P49615 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cdk5P49615 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cdk5P49615 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cdk5P49615 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cdk5P49615 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cdk5P49615 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Cdk5P49615 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms