Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LmnaP48678 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LmnaP48678 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LmnaP48678 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LmnaP48678 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LmnaP48678 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LmnaP48678 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LmnaP48678 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LmnaP48678 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LmnaP48678 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LmnaP48678 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LmnaP48678 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LmnaP48678 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LmnaP48678 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LmnaP48678 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LmnaP48678 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LmnaP48678 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LmnaP48678 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LmnaP48678 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LmnaP48678 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LmnaP48678 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LmnaP48678 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LmnaP48678 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LmnaP48678 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LmnaP48678 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LmnaP48678 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LmnaP48678 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LmnaP48678 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LmnaP48678 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LmnaP48678 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LmnaP48678 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LmnaP48678 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LmnaP48678 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LmnaP48678 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LmnaP48678 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LmnaP48678 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LmnaP48678 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LmnaP48678 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LmnaP48678 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LmnaP48678 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LmnaP48678 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LmnaP48678 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LmnaP48678 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LmnaP48678 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LmnaP48678 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LmnaP48678 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LmnaP48678 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LmnaP48678 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LmnaP48678 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LmnaP48678 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LmnaP48678 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LmnaP48678 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LmnaP48678 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LmnaP48678 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LmnaP48678 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LmnaP48678 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LmnaP48678 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LmnaP48678 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LmnaP48678 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LmnaP48678 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LmnaP48678 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LmnaP48678 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LmnaP48678 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LmnaP48678 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LmnaP48678 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LmnaP48678 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LmnaP48678 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LmnaP48678 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LmnaP48678 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LmnaP48678 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LmnaP48678 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LmnaP48678 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LmnaP48678 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LmnaP48678 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LmnaP48678 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LmnaP48678 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LmnaP48678 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LmnaP48678 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LmnaP48678 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LmnaP48678 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LmnaP48678 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LmnaP48678 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LmnaP48678 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LmnaP48678 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LmnaP48678 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LmnaP48678 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LmnaP48678 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LmnaP48678 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LmnaP48678 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LmnaP48678 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LmnaP48678 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LmnaP48678 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LmnaP48678 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LmnaP48678 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LmnaP48678 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LmnaP48678 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LmnaP48678 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LmnaP48678 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LmnaP48678 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LmnaP48678 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms