Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rfx1P48377 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rfx1P48377 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rfx1P48377 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rfx1P48377 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rfx1P48377 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rfx1P48377 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rfx1P48377 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Rfx1P48377 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rfx1P48377 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rfx1P48377 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rfx1P48377 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rfx1P48377 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rfx1P48377 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rfx1P48377 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rfx1P48377 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rfx1P48377 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rfx1P48377 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rfx1P48377 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rfx1P48377 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rfx1P48377 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rfx1P48377 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rfx1P48377 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rfx1P48377 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rfx1P48377 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rfx1P48377 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Rfx1P48377 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rfx1P48377 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rfx1P48377 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rfx1P48377 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rfx1P48377 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rfx1P48377 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rfx1P48377 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rfx1P48377 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rfx1P48377 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rfx1P48377 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rfx1P48377 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rfx1P48377 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rfx1P48377 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rfx1P48377 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rfx1P48377 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rfx1P48377 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rfx1P48377 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rfx1P48377 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rfx1P48377 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rfx1P48377 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rfx1P48377 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rfx1P48377 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rfx1P48377 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rfx1P48377 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Rfx1P48377 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rfx1P48377 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Rfx1P48377 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Rfx1P48377 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Rfx1P48377 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rfx1P48377 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rfx1P48377 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rfx1P48377 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rfx1P48377 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Rfx1P48377 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rfx1P48377 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Rfx1P48377 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Rfx1P48377 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Rfx1P48377 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rfx1P48377 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rfx1P48377 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rfx1P48377 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rfx1P48377 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rfx1P48377 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rfx1P48377 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rfx1P48377 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rfx1P48377 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rfx1P48377 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rfx1P48377 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rfx1P48377 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rfx1P48377 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rfx1P48377 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rfx1P48377 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rfx1P48377 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rfx1P48377 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rfx1P48377 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rfx1P48377 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Rfx1P48377 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rfx1P48377 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Rfx1P48377 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Rfx1P48377 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Rfx1P48377 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Rfx1P48377 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rfx1P48377 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rfx1P48377 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rfx1P48377 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rfx1P48377 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rfx1P48377 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rfx1P48377 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rfx1P48377 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rfx1P48377 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rfx1P48377 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rfx1P48377 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rfx1P48377 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Rfx1P48377 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms