Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gbx2P48031 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gbx2P48031 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gbx2P48031 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gbx2P48031 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gbx2P48031 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gbx2P48031 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gbx2P48031 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gbx2P48031 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gbx2P48031 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gbx2P48031 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Gbx2P48031 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gbx2P48031 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gbx2P48031 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gbx2P48031 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gbx2P48031 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gbx2P48031 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gbx2P48031 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gbx2P48031 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gbx2P48031 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gbx2P48031 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gbx2P48031 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gbx2P48031 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gbx2P48031 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gbx2P48031 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gbx2P48031 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gbx2P48031 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gbx2P48031 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gbx2P48031 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gbx2P48031 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gbx2P48031 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gbx2P48031 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gbx2P48031 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gbx2P48031 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gbx2P48031 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gbx2P48031 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gbx2P48031 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gbx2P48031 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gbx2P48031 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gbx2P48031 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gbx2P48031 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gbx2P48031 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gbx2P48031 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gbx2P48031 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Gbx2P48031 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gbx2P48031 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gbx2P48031 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gbx2P48031 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gbx2P48031 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gbx2P48031 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gbx2P48031 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gbx2P48031 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gbx2P48031 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gbx2P48031 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gbx2P48031 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gbx2P48031 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gbx2P48031 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gbx2P48031 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gbx2P48031 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gbx2P48031 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gbx2P48031 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gbx2P48031 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gbx2P48031 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gbx2P48031 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gbx2P48031 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gbx2P48031 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gbx2P48031 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Gbx2P48031 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gbx2P48031 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gbx2P48031 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gbx2P48031 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gbx2P48031 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gbx2P48031 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gbx2P48031 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Gbx2P48031 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gbx2P48031 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gbx2P48031 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gbx2P48031 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gbx2P48031 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gbx2P48031 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gbx2P48031 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gbx2P48031 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gbx2P48031 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gbx2P48031 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Gbx2P48031 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gbx2P48031 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gbx2P48031 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gbx2P48031 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gbx2P48031 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gbx2P48031 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gbx2P48031 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gbx2P48031 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gbx2P48031 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gbx2P48031 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gbx2P48031 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Gbx2P48031 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gbx2P48031 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gbx2P48031 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gbx2P48031 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gbx2P48031 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms