Protein–RNA interactions for Protein: P47941

Crkl, Crk-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrklP47941 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CrklP47941 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CrklP47941 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CrklP47941 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CrklP47941 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CrklP47941 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CrklP47941 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CrklP47941 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CrklP47941 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CrklP47941 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CrklP47941 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CrklP47941 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CrklP47941 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CrklP47941 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CrklP47941 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CrklP47941 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CrklP47941 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CrklP47941 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CrklP47941 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CrklP47941 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CrklP47941 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CrklP47941 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CrklP47941 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CrklP47941 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CrklP47941 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CrklP47941 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CrklP47941 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CrklP47941 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CrklP47941 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CrklP47941 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CrklP47941 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CrklP47941 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CrklP47941 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CrklP47941 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CrklP47941 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CrklP47941 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CrklP47941 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CrklP47941 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CrklP47941 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CrklP47941 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CrklP47941 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CrklP47941 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CrklP47941 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CrklP47941 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CrklP47941 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CrklP47941 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CrklP47941 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CrklP47941 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CrklP47941 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CrklP47941 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CrklP47941 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CrklP47941 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CrklP47941 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CrklP47941 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CrklP47941 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CrklP47941 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CrklP47941 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CrklP47941 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CrklP47941 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CrklP47941 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CrklP47941 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CrklP47941 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CrklP47941 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CrklP47941 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CrklP47941 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CrklP47941 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CrklP47941 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CrklP47941 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CrklP47941 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CrklP47941 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CrklP47941 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CrklP47941 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CrklP47941 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CrklP47941 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CrklP47941 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CrklP47941 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CrklP47941 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CrklP47941 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CrklP47941 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CrklP47941 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CrklP47941 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CrklP47941 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CrklP47941 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CrklP47941 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CrklP47941 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CrklP47941 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CrklP47941 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CrklP47941 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CrklP47941 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CrklP47941 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CrklP47941 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CrklP47941 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CrklP47941 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CrklP47941 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CrklP47941 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CrklP47941 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CrklP47941 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CrklP47941 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CrklP47941 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CrklP47941 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms