Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SrprbP47758 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SrprbP47758 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SrprbP47758 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SrprbP47758 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SrprbP47758 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SrprbP47758 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SrprbP47758 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SrprbP47758 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SrprbP47758 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SrprbP47758 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SrprbP47758 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SrprbP47758 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SrprbP47758 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SrprbP47758 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SrprbP47758 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SrprbP47758 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SrprbP47758 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SrprbP47758 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SrprbP47758 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SrprbP47758 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SrprbP47758 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SrprbP47758 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SrprbP47758 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SrprbP47758 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SrprbP47758 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SrprbP47758 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SrprbP47758 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SrprbP47758 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SrprbP47758 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SrprbP47758 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
SrprbP47758 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SrprbP47758 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SrprbP47758 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SrprbP47758 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SrprbP47758 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SrprbP47758 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SrprbP47758 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SrprbP47758 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SrprbP47758 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SrprbP47758 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SrprbP47758 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SrprbP47758 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SrprbP47758 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SrprbP47758 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SrprbP47758 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SrprbP47758 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SrprbP47758 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SrprbP47758 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SrprbP47758 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SrprbP47758 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SrprbP47758 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SrprbP47758 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SrprbP47758 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SrprbP47758 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SrprbP47758 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SrprbP47758 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SrprbP47758 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SrprbP47758 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SrprbP47758 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SrprbP47758 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SrprbP47758 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SrprbP47758 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SrprbP47758 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SrprbP47758 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SrprbP47758 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SrprbP47758 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SrprbP47758 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SrprbP47758 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SrprbP47758 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SrprbP47758 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SrprbP47758 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SrprbP47758 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SrprbP47758 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SrprbP47758 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SrprbP47758 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SrprbP47758 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SrprbP47758 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SrprbP47758 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SrprbP47758 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SrprbP47758 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SrprbP47758 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SrprbP47758 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SrprbP47758 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SrprbP47758 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SrprbP47758 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SrprbP47758 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SrprbP47758 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SrprbP47758 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SrprbP47758 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SrprbP47758 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SrprbP47758 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SrprbP47758 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SrprbP47758 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SrprbP47758 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SrprbP47758 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SrprbP47758 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SrprbP47758 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SrprbP47758 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SrprbP47758 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms