Protein–RNA interactions for Protein: P42703

Lifr, Leukemia inhibitory factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,092 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LifrP42703 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
LifrP42703 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LifrP42703 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LifrP42703 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LifrP42703 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LifrP42703 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
LifrP42703 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LifrP42703 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LifrP42703 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LifrP42703 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LifrP42703 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LifrP42703 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
LifrP42703 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LifrP42703 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LifrP42703 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LifrP42703 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LifrP42703 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LifrP42703 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LifrP42703 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
LifrP42703 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LifrP42703 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LifrP42703 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LifrP42703 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
LifrP42703 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LifrP42703 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LifrP42703 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LifrP42703 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LifrP42703 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LifrP42703 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LifrP42703 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LifrP42703 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LifrP42703 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LifrP42703 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LifrP42703 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LifrP42703 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
LifrP42703 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LifrP42703 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LifrP42703 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LifrP42703 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LifrP42703 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LifrP42703 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LifrP42703 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LifrP42703 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LifrP42703 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LifrP42703 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LifrP42703 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LifrP42703 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LifrP42703 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LifrP42703 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LifrP42703 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LifrP42703 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LifrP42703 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LifrP42703 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LifrP42703 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LifrP42703 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LifrP42703 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LifrP42703 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LifrP42703 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LifrP42703 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LifrP42703 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LifrP42703 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LifrP42703 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LifrP42703 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LifrP42703 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LifrP42703 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LifrP42703 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LifrP42703 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LifrP42703 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LifrP42703 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LifrP42703 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LifrP42703 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LifrP42703 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LifrP42703 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
LifrP42703 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LifrP42703 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LifrP42703 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
LifrP42703 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LifrP42703 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LifrP42703 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LifrP42703 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LifrP42703 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LifrP42703 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LifrP42703 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LifrP42703 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LifrP42703 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LifrP42703 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LifrP42703 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LifrP42703 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LifrP42703 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LifrP42703 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LifrP42703 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LifrP42703 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LifrP42703 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LifrP42703 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LifrP42703 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LifrP42703 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LifrP42703 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LifrP42703 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LifrP42703 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LifrP42703 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 165.6 ms