Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nkx1-2P42580 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nkx1-2P42580 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nkx1-2P42580 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nkx1-2P42580 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nkx1-2P42580 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nkx1-2P42580 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nkx1-2P42580 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Nkx1-2P42580 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nkx1-2P42580 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Nkx1-2P42580 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nkx1-2P42580 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nkx1-2P42580 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nkx1-2P42580 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nkx1-2P42580 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nkx1-2P42580 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nkx1-2P42580 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nkx1-2P42580 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nkx1-2P42580 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Nkx1-2P42580 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nkx1-2P42580 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nkx1-2P42580 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Nkx1-2P42580 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nkx1-2P42580 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nkx1-2P42580 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nkx1-2P42580 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nkx1-2P42580 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Nkx1-2P42580 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Nkx1-2P42580 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nkx1-2P42580 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nkx1-2P42580 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Nkx1-2P42580 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Nkx1-2P42580 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nkx1-2P42580 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nkx1-2P42580 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nkx1-2P42580 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nkx1-2P42580 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nkx1-2P42580 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nkx1-2P42580 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nkx1-2P42580 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nkx1-2P42580 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nkx1-2P42580 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nkx1-2P42580 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nkx1-2P42580 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nkx1-2P42580 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nkx1-2P42580 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nkx1-2P42580 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Nkx1-2P42580 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Nkx1-2P42580 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nkx1-2P42580 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nkx1-2P42580 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nkx1-2P42580 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Nkx1-2P42580 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nkx1-2P42580 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Nkx1-2P42580 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nkx1-2P42580 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nkx1-2P42580 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nkx1-2P42580 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nkx1-2P42580 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nkx1-2P42580 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nkx1-2P42580 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nkx1-2P42580 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nkx1-2P42580 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nkx1-2P42580 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nkx1-2P42580 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nkx1-2P42580 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nkx1-2P42580 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nkx1-2P42580 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nkx1-2P42580 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nkx1-2P42580 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nkx1-2P42580 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nkx1-2P42580 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nkx1-2P42580 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nkx1-2P42580 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nkx1-2P42580 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nkx1-2P42580 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nkx1-2P42580 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nkx1-2P42580 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nkx1-2P42580 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nkx1-2P42580 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nkx1-2P42580 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nkx1-2P42580 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nkx1-2P42580 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nkx1-2P42580 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Nkx1-2P42580 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Nkx1-2P42580 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nkx1-2P42580 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nkx1-2P42580 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nkx1-2P42580 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nkx1-2P42580 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nkx1-2P42580 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nkx1-2P42580 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nkx1-2P42580 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nkx1-2P42580 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nkx1-2P42580 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nkx1-2P42580 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nkx1-2P42580 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nkx1-2P42580 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nkx1-2P42580 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nkx1-2P42580 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136 ms