Protein–RNA interactions for Protein: P41971

Elk3, ETS domain-containing protein Elk-3, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elk3P41971 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Elk3P41971 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Elk3P41971 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Elk3P41971 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Elk3P41971 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Elk3P41971 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Elk3P41971 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Elk3P41971 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Elk3P41971 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Elk3P41971 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Elk3P41971 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Elk3P41971 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Elk3P41971 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Elk3P41971 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Elk3P41971 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Elk3P41971 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Elk3P41971 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Elk3P41971 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Elk3P41971 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Elk3P41971 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Elk3P41971 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Elk3P41971 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Elk3P41971 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Elk3P41971 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Elk3P41971 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Elk3P41971 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Elk3P41971 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Elk3P41971 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Elk3P41971 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Elk3P41971 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Elk3P41971 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Elk3P41971 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Elk3P41971 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Elk3P41971 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Elk3P41971 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Elk3P41971 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Elk3P41971 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Elk3P41971 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Elk3P41971 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Elk3P41971 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Elk3P41971 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Elk3P41971 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Elk3P41971 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Elk3P41971 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Elk3P41971 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Elk3P41971 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Elk3P41971 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Elk3P41971 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Elk3P41971 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Elk3P41971 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Elk3P41971 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Elk3P41971 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Elk3P41971 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Elk3P41971 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Elk3P41971 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Elk3P41971 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Elk3P41971 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Elk3P41971 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Elk3P41971 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Elk3P41971 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Elk3P41971 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Elk3P41971 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Elk3P41971 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Elk3P41971 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Elk3P41971 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Elk3P41971 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Elk3P41971 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Elk3P41971 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Elk3P41971 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Elk3P41971 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Elk3P41971 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Elk3P41971 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Elk3P41971 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Elk3P41971 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Elk3P41971 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Elk3P41971 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Elk3P41971 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Elk3P41971 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Elk3P41971 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Elk3P41971 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Elk3P41971 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Elk3P41971 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Elk3P41971 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Elk3P41971 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Elk3P41971 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Elk3P41971 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Elk3P41971 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Elk3P41971 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Elk3P41971 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Elk3P41971 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Elk3P41971 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Elk3P41971 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Elk3P41971 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Elk3P41971 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Elk3P41971 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Elk3P41971 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Elk3P41971 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Elk3P41971 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Elk3P41971 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Elk3P41971 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms