Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LtbP41155 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LtbP41155 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LtbP41155 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LtbP41155 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LtbP41155 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LtbP41155 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LtbP41155 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LtbP41155 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LtbP41155 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LtbP41155 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LtbP41155 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LtbP41155 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LtbP41155 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LtbP41155 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LtbP41155 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LtbP41155 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LtbP41155 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LtbP41155 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LtbP41155 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LtbP41155 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LtbP41155 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LtbP41155 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LtbP41155 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LtbP41155 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LtbP41155 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LtbP41155 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LtbP41155 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LtbP41155 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LtbP41155 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LtbP41155 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LtbP41155 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LtbP41155 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LtbP41155 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LtbP41155 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LtbP41155 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LtbP41155 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LtbP41155 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LtbP41155 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LtbP41155 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LtbP41155 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LtbP41155 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LtbP41155 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LtbP41155 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LtbP41155 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LtbP41155 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LtbP41155 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LtbP41155 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LtbP41155 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LtbP41155 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LtbP41155 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LtbP41155 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LtbP41155 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LtbP41155 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LtbP41155 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LtbP41155 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LtbP41155 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LtbP41155 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LtbP41155 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LtbP41155 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LtbP41155 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LtbP41155 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LtbP41155 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LtbP41155 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LtbP41155 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LtbP41155 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LtbP41155 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LtbP41155 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LtbP41155 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LtbP41155 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LtbP41155 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LtbP41155 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LtbP41155 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LtbP41155 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LtbP41155 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LtbP41155 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LtbP41155 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LtbP41155 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LtbP41155 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LtbP41155 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LtbP41155 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LtbP41155 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LtbP41155 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LtbP41155 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LtbP41155 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LtbP41155 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LtbP41155 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LtbP41155 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LtbP41155 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LtbP41155 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LtbP41155 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LtbP41155 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LtbP41155 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LtbP41155 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LtbP41155 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LtbP41155 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LtbP41155 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LtbP41155 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LtbP41155 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LtbP41155 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms