Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VhlP40338 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VhlP40338 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VhlP40338 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VhlP40338 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VhlP40338 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VhlP40338 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VhlP40338 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VhlP40338 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VhlP40338 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VhlP40338 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VhlP40338 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VhlP40338 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VhlP40338 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VhlP40338 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VhlP40338 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VhlP40338 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VhlP40338 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VhlP40338 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VhlP40338 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VhlP40338 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VhlP40338 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VhlP40338 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VhlP40338 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VhlP40338 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VhlP40338 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VhlP40338 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
VhlP40338 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VhlP40338 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VhlP40338 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VhlP40338 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VhlP40338 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VhlP40338 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VhlP40338 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VhlP40338 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VhlP40338 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VhlP40338 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VhlP40338 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
VhlP40338 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VhlP40338 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VhlP40338 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VhlP40338 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VhlP40338 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VhlP40338 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VhlP40338 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VhlP40338 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VhlP40338 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VhlP40338 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VhlP40338 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VhlP40338 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VhlP40338 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VhlP40338 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VhlP40338 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VhlP40338 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VhlP40338 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VhlP40338 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VhlP40338 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VhlP40338 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VhlP40338 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VhlP40338 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
VhlP40338 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VhlP40338 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VhlP40338 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VhlP40338 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VhlP40338 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VhlP40338 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VhlP40338 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VhlP40338 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VhlP40338 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VhlP40338 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VhlP40338 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VhlP40338 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VhlP40338 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VhlP40338 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VhlP40338 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VhlP40338 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VhlP40338 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VhlP40338 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VhlP40338 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VhlP40338 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
VhlP40338 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VhlP40338 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VhlP40338 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VhlP40338 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VhlP40338 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VhlP40338 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VhlP40338 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VhlP40338 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VhlP40338 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VhlP40338 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VhlP40338 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VhlP40338 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VhlP40338 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VhlP40338 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VhlP40338 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VhlP40338 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VhlP40338 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VhlP40338 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VhlP40338 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VhlP40338 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms