Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grik2P39087 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grik2P39087 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grik2P39087 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grik2P39087 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Grik2P39087 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Grik2P39087 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Grik2P39087 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Grik2P39087 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Grik2P39087 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Grik2P39087 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Grik2P39087 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Grik2P39087 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Grik2P39087 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Grik2P39087 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Grik2P39087 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Grik2P39087 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Grik2P39087 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Grik2P39087 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Grik2P39087 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Grik2P39087 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Grik2P39087 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Grik2P39087 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Grik2P39087 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Grik2P39087 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Grik2P39087 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Grik2P39087 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Grik2P39087 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Grik2P39087 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Grik2P39087 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Grik2P39087 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Grik2P39087 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Grik2P39087 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Grik2P39087 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Grik2P39087 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Grik2P39087 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Grik2P39087 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Grik2P39087 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Grik2P39087 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Grik2P39087 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Grik2P39087 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Grik2P39087 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Grik2P39087 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Grik2P39087 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Grik2P39087 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Grik2P39087 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Grik2P39087 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Grik2P39087 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Grik2P39087 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Grik2P39087 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Grik2P39087 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Grik2P39087 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Grik2P39087 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Grik2P39087 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Grik2P39087 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Grik2P39087 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Grik2P39087 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Grik2P39087 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Grik2P39087 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Grik2P39087 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Grik2P39087 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Grik2P39087 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Grik2P39087 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Grik2P39087 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Grik2P39087 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Grik2P39087 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Grik2P39087 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Grik2P39087 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Grik2P39087 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Grik2P39087 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Grik2P39087 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Grik2P39087 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Grik2P39087 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Grik2P39087 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Grik2P39087 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Grik2P39087 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Grik2P39087 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Grik2P39087 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Grik2P39087 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Grik2P39087 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Grik2P39087 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Grik2P39087 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Grik2P39087 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Grik2P39087 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Grik2P39087 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Grik2P39087 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Grik2P39087 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Grik2P39087 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Grik2P39087 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Grik2P39087 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Grik2P39087 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Grik2P39087 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Grik2P39087 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Grik2P39087 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Grik2P39087 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Grik2P39087 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Grik2P39087 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Grik2P39087 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Grik2P39087 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Grik2P39087 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms