Protein–RNA interactions for Protein: P35710

Sox5, Transcription factor SOX-5, mousemouse

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox5P35710 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sox5P35710 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sox5P35710 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sox5P35710 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sox5P35710 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sox5P35710 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sox5P35710 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sox5P35710 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sox5P35710 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sox5P35710 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sox5P35710 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sox5P35710 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sox5P35710 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sox5P35710 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sox5P35710 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Sox5P35710 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sox5P35710 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sox5P35710 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sox5P35710 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sox5P35710 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Sox5P35710 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sox5P35710 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sox5P35710 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sox5P35710 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sox5P35710 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sox5P35710 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sox5P35710 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sox5P35710 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sox5P35710 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Sox5P35710 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sox5P35710 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sox5P35710 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sox5P35710 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sox5P35710 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Sox5P35710 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sox5P35710 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sox5P35710 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sox5P35710 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Sox5P35710 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sox5P35710 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sox5P35710 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sox5P35710 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sox5P35710 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sox5P35710 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sox5P35710 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sox5P35710 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sox5P35710 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sox5P35710 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Sox5P35710 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sox5P35710 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sox5P35710 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sox5P35710 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sox5P35710 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sox5P35710 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sox5P35710 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sox5P35710 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sox5P35710 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sox5P35710 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sox5P35710 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sox5P35710 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sox5P35710 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sox5P35710 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sox5P35710 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sox5P35710 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sox5P35710 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sox5P35710 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sox5P35710 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sox5P35710 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sox5P35710 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sox5P35710 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sox5P35710 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sox5P35710 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sox5P35710 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sox5P35710 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sox5P35710 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sox5P35710 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sox5P35710 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sox5P35710 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Sox5P35710 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sox5P35710 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sox5P35710 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sox5P35710 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sox5P35710 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sox5P35710 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sox5P35710 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sox5P35710 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sox5P35710 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Sox5P35710 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sox5P35710 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sox5P35710 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sox5P35710 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sox5P35710 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sox5P35710 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sox5P35710 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sox5P35710 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sox5P35710 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sox5P35710 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sox5P35710 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Sox5P35710 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sox5P35710 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms