Protein–RNA interactions for Protein: P35436

Grin2a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2aP35436 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Grin2aP35436 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Grin2aP35436 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Grin2aP35436 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Grin2aP35436 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Grin2aP35436 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Grin2aP35436 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Grin2aP35436 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Grin2aP35436 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
Grin2aP35436 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Grin2aP35436 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Grin2aP35436 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Grin2aP35436 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
Grin2aP35436 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Grin2aP35436 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Grin2aP35436 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Grin2aP35436 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Grin2aP35436 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
Grin2aP35436 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Grin2aP35436 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Grin2aP35436 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Grin2aP35436 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Grin2aP35436 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Grin2aP35436 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Grin2aP35436 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Grin2aP35436 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Grin2aP35436 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Grin2aP35436 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Grin2aP35436 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Grin2aP35436 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Grin2aP35436 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Grin2aP35436 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Grin2aP35436 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
Grin2aP35436 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Grin2aP35436 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Grin2aP35436 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Grin2aP35436 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Grin2aP35436 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Grin2aP35436 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Grin2aP35436 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Grin2aP35436 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Grin2aP35436 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
Grin2aP35436 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
Grin2aP35436 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Grin2aP35436 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Grin2aP35436 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
Grin2aP35436 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Grin2aP35436 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Grin2aP35436 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Grin2aP35436 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Grin2aP35436 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Grin2aP35436 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Grin2aP35436 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Grin2aP35436 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Grin2aP35436 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Grin2aP35436 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC33.82■■■■□ 3
Grin2aP35436 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Grin2aP35436 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Grin2aP35436 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
Grin2aP35436 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC33.8■■■■□ 3
Grin2aP35436 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Grin2aP35436 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
Grin2aP35436 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Grin2aP35436 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
Grin2aP35436 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Grin2aP35436 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Grin2aP35436 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
Grin2aP35436 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC33.78■■■■□ 3
Grin2aP35436 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
Grin2aP35436 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC33.77■■■■□ 3
Grin2aP35436 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Grin2aP35436 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Grin2aP35436 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Grin2aP35436 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC33.76■■■■□ 3
Grin2aP35436 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■■□ 3
Grin2aP35436 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Grin2aP35436 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Grin2aP35436 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Grin2aP35436 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Grin2aP35436 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Grin2aP35436 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Grin2aP35436 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Grin2aP35436 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Grin2aP35436 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Grin2aP35436 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Grin2aP35436 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Grin2aP35436 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Grin2aP35436 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Grin2aP35436 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Grin2aP35436 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Grin2aP35436 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Grin2aP35436 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Grin2aP35436 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Grin2aP35436 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Grin2aP35436 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Grin2aP35436 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Grin2aP35436 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Grin2aP35436 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Grin2aP35436 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Grin2aP35436 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms