Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptpn11P35235 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptpn11P35235 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptpn11P35235 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptpn11P35235 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptpn11P35235 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptpn11P35235 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptpn11P35235 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptpn11P35235 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptpn11P35235 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptpn11P35235 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptpn11P35235 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptpn11P35235 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptpn11P35235 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptpn11P35235 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptpn11P35235 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptpn11P35235 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptpn11P35235 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptpn11P35235 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptpn11P35235 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptpn11P35235 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptpn11P35235 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptpn11P35235 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ptpn11P35235 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ptpn11P35235 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ptpn11P35235 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ptpn11P35235 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ptpn11P35235 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ptpn11P35235 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ptpn11P35235 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ptpn11P35235 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ptpn11P35235 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ptpn11P35235 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ptpn11P35235 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ptpn11P35235 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ptpn11P35235 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ptpn11P35235 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ptpn11P35235 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ptpn11P35235 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ptpn11P35235 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ptpn11P35235 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ptpn11P35235 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ptpn11P35235 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ptpn11P35235 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ptpn11P35235 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ptpn11P35235 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ptpn11P35235 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ptpn11P35235 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ptpn11P35235 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ptpn11P35235 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ptpn11P35235 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ptpn11P35235 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ptpn11P35235 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ptpn11P35235 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ptpn11P35235 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ptpn11P35235 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ptpn11P35235 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ptpn11P35235 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ptpn11P35235 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ptpn11P35235 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ptpn11P35235 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ptpn11P35235 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ptpn11P35235 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ptpn11P35235 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ptpn11P35235 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ptpn11P35235 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ptpn11P35235 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ptpn11P35235 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ptpn11P35235 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ptpn11P35235 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ptpn11P35235 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ptpn11P35235 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ptpn11P35235 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ptpn11P35235 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ptpn11P35235 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ptpn11P35235 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ptpn11P35235 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ptpn11P35235 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Ptpn11P35235 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ptpn11P35235 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ptpn11P35235 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ptpn11P35235 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ptpn11P35235 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ptpn11P35235 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ptpn11P35235 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ptpn11P35235 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ptpn11P35235 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ptpn11P35235 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ptpn11P35235 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ptpn11P35235 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ptpn11P35235 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ptpn11P35235 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ptpn11P35235 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ptpn11P35235 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Ptpn11P35235 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ptpn11P35235 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ptpn11P35235 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ptpn11P35235 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ptpn11P35235 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ptpn11P35235 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms