Protein–RNA interactions for Protein: P33896

Ifnar1, Interferon alpha/beta receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnar1P33896 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ifnar1P33896 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ifnar1P33896 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ifnar1P33896 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ifnar1P33896 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ifnar1P33896 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ifnar1P33896 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ifnar1P33896 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ifnar1P33896 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ifnar1P33896 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ifnar1P33896 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ifnar1P33896 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ifnar1P33896 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ifnar1P33896 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ifnar1P33896 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ifnar1P33896 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ifnar1P33896 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ifnar1P33896 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ifnar1P33896 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ifnar1P33896 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ifnar1P33896 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ifnar1P33896 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ifnar1P33896 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ifnar1P33896 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ifnar1P33896 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ifnar1P33896 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ifnar1P33896 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ifnar1P33896 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ifnar1P33896 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ifnar1P33896 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ifnar1P33896 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ifnar1P33896 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ifnar1P33896 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ifnar1P33896 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ifnar1P33896 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ifnar1P33896 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ifnar1P33896 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ifnar1P33896 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ifnar1P33896 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ifnar1P33896 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ifnar1P33896 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ifnar1P33896 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ifnar1P33896 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ifnar1P33896 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ifnar1P33896 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ifnar1P33896 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ifnar1P33896 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ifnar1P33896 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ifnar1P33896 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ifnar1P33896 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ifnar1P33896 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ifnar1P33896 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ifnar1P33896 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ifnar1P33896 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ifnar1P33896 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ifnar1P33896 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ifnar1P33896 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ifnar1P33896 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ifnar1P33896 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ifnar1P33896 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ifnar1P33896 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ifnar1P33896 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ifnar1P33896 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ifnar1P33896 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ifnar1P33896 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ifnar1P33896 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ifnar1P33896 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ifnar1P33896 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ifnar1P33896 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ifnar1P33896 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ifnar1P33896 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ifnar1P33896 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ifnar1P33896 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ifnar1P33896 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ifnar1P33896 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ifnar1P33896 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ifnar1P33896 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ifnar1P33896 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ifnar1P33896 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ifnar1P33896 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ifnar1P33896 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ifnar1P33896 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ifnar1P33896 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ifnar1P33896 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ifnar1P33896 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ifnar1P33896 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ifnar1P33896 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ifnar1P33896 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ifnar1P33896 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ifnar1P33896 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ifnar1P33896 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ifnar1P33896 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ifnar1P33896 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ifnar1P33896 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ifnar1P33896 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ifnar1P33896 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ifnar1P33896 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ifnar1P33896 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ifnar1P33896 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ifnar1P33896 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms