Protein–RNA interactions for Protein: P33146

Cdh15, Cadherin-15, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh15P33146 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdh15P33146 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdh15P33146 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdh15P33146 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdh15P33146 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdh15P33146 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdh15P33146 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdh15P33146 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdh15P33146 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdh15P33146 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdh15P33146 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdh15P33146 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdh15P33146 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdh15P33146 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdh15P33146 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdh15P33146 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdh15P33146 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdh15P33146 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdh15P33146 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdh15P33146 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdh15P33146 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdh15P33146 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdh15P33146 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdh15P33146 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdh15P33146 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdh15P33146 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdh15P33146 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdh15P33146 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdh15P33146 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdh15P33146 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdh15P33146 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdh15P33146 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdh15P33146 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdh15P33146 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdh15P33146 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdh15P33146 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdh15P33146 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdh15P33146 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdh15P33146 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdh15P33146 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdh15P33146 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdh15P33146 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdh15P33146 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdh15P33146 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdh15P33146 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdh15P33146 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdh15P33146 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdh15P33146 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdh15P33146 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdh15P33146 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdh15P33146 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdh15P33146 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdh15P33146 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdh15P33146 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdh15P33146 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdh15P33146 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdh15P33146 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdh15P33146 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdh15P33146 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdh15P33146 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdh15P33146 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdh15P33146 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdh15P33146 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdh15P33146 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cdh15P33146 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cdh15P33146 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cdh15P33146 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdh15P33146 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdh15P33146 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdh15P33146 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdh15P33146 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdh15P33146 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdh15P33146 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdh15P33146 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdh15P33146 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdh15P33146 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdh15P33146 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdh15P33146 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdh15P33146 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdh15P33146 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdh15P33146 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdh15P33146 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdh15P33146 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdh15P33146 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdh15P33146 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdh15P33146 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdh15P33146 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdh15P33146 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdh15P33146 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdh15P33146 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdh15P33146 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdh15P33146 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdh15P33146 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdh15P33146 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdh15P33146 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdh15P33146 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdh15P33146 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdh15P33146 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdh15P33146 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdh15P33146 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms