Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxc10P31257 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxc10P31257 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxc10P31257 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxc10P31257 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxc10P31257 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxc10P31257 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxc10P31257 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxc10P31257 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxc10P31257 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxc10P31257 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxc10P31257 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxc10P31257 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxc10P31257 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxc10P31257 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxc10P31257 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxc10P31257 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxc10P31257 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxc10P31257 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxc10P31257 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hoxc10P31257 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hoxc10P31257 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hoxc10P31257 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hoxc10P31257 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hoxc10P31257 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hoxc10P31257 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hoxc10P31257 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxc10P31257 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxc10P31257 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxc10P31257 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxc10P31257 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hoxc10P31257 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Hoxc10P31257 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hoxc10P31257 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hoxc10P31257 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hoxc10P31257 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hoxc10P31257 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hoxc10P31257 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hoxc10P31257 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hoxc10P31257 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hoxc10P31257 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hoxc10P31257 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hoxc10P31257 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hoxc10P31257 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hoxc10P31257 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hoxc10P31257 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hoxc10P31257 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hoxc10P31257 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hoxc10P31257 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hoxc10P31257 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxc10P31257 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxc10P31257 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxc10P31257 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxc10P31257 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxc10P31257 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxc10P31257 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxc10P31257 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxc10P31257 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxc10P31257 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxc10P31257 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxc10P31257 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxc10P31257 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxc10P31257 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxc10P31257 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hoxc10P31257 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hoxc10P31257 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hoxc10P31257 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hoxc10P31257 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxc10P31257 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxc10P31257 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxc10P31257 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxc10P31257 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxc10P31257 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxc10P31257 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hoxc10P31257 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hoxc10P31257 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hoxc10P31257 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hoxc10P31257 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hoxc10P31257 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxc10P31257 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxc10P31257 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxc10P31257 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxc10P31257 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxc10P31257 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxc10P31257 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxc10P31257 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxc10P31257 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxc10P31257 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxc10P31257 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxc10P31257 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxc10P31257 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxc10P31257 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxc10P31257 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxc10P31257 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxc10P31257 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxc10P31257 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxc10P31257 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxc10P31257 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxc10P31257 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxc10P31257 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms