Protein–RNA interactions for Protein: P29533

Vcam1, Vascular cell adhesion protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vcam1P29533 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vcam1P29533 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vcam1P29533 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vcam1P29533 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vcam1P29533 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vcam1P29533 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vcam1P29533 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vcam1P29533 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vcam1P29533 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vcam1P29533 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vcam1P29533 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vcam1P29533 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vcam1P29533 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vcam1P29533 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vcam1P29533 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vcam1P29533 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vcam1P29533 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vcam1P29533 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vcam1P29533 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vcam1P29533 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vcam1P29533 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vcam1P29533 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vcam1P29533 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vcam1P29533 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Vcam1P29533 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vcam1P29533 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vcam1P29533 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vcam1P29533 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vcam1P29533 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vcam1P29533 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vcam1P29533 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vcam1P29533 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vcam1P29533 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vcam1P29533 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vcam1P29533 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vcam1P29533 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vcam1P29533 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vcam1P29533 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vcam1P29533 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Vcam1P29533 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vcam1P29533 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vcam1P29533 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vcam1P29533 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vcam1P29533 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vcam1P29533 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vcam1P29533 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vcam1P29533 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vcam1P29533 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Vcam1P29533 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vcam1P29533 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vcam1P29533 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vcam1P29533 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vcam1P29533 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vcam1P29533 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vcam1P29533 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vcam1P29533 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vcam1P29533 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vcam1P29533 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vcam1P29533 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vcam1P29533 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vcam1P29533 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vcam1P29533 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vcam1P29533 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vcam1P29533 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vcam1P29533 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vcam1P29533 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vcam1P29533 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vcam1P29533 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Vcam1P29533 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vcam1P29533 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vcam1P29533 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vcam1P29533 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vcam1P29533 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vcam1P29533 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vcam1P29533 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vcam1P29533 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Vcam1P29533 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Vcam1P29533 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vcam1P29533 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vcam1P29533 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vcam1P29533 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vcam1P29533 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vcam1P29533 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vcam1P29533 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vcam1P29533 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vcam1P29533 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Vcam1P29533 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vcam1P29533 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vcam1P29533 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vcam1P29533 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vcam1P29533 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Vcam1P29533 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vcam1P29533 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vcam1P29533 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vcam1P29533 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vcam1P29533 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vcam1P29533 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vcam1P29533 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vcam1P29533 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vcam1P29533 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms