Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pabpc1P29341 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pabpc1P29341 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pabpc1P29341 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pabpc1P29341 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pabpc1P29341 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pabpc1P29341 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pabpc1P29341 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pabpc1P29341 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pabpc1P29341 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pabpc1P29341 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pabpc1P29341 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pabpc1P29341 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pabpc1P29341 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pabpc1P29341 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Pabpc1P29341 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pabpc1P29341 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Pabpc1P29341 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pabpc1P29341 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pabpc1P29341 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Pabpc1P29341 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pabpc1P29341 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pabpc1P29341 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pabpc1P29341 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pabpc1P29341 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pabpc1P29341 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pabpc1P29341 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pabpc1P29341 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pabpc1P29341 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pabpc1P29341 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pabpc1P29341 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pabpc1P29341 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pabpc1P29341 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pabpc1P29341 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Pabpc1P29341 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pabpc1P29341 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pabpc1P29341 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pabpc1P29341 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pabpc1P29341 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pabpc1P29341 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pabpc1P29341 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pabpc1P29341 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pabpc1P29341 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pabpc1P29341 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pabpc1P29341 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pabpc1P29341 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pabpc1P29341 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pabpc1P29341 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pabpc1P29341 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pabpc1P29341 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pabpc1P29341 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pabpc1P29341 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pabpc1P29341 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pabpc1P29341 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pabpc1P29341 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pabpc1P29341 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pabpc1P29341 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pabpc1P29341 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pabpc1P29341 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pabpc1P29341 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pabpc1P29341 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pabpc1P29341 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pabpc1P29341 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pabpc1P29341 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pabpc1P29341 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pabpc1P29341 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pabpc1P29341 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Pabpc1P29341 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pabpc1P29341 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pabpc1P29341 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pabpc1P29341 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pabpc1P29341 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pabpc1P29341 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pabpc1P29341 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pabpc1P29341 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pabpc1P29341 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pabpc1P29341 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pabpc1P29341 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pabpc1P29341 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Pabpc1P29341 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pabpc1P29341 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pabpc1P29341 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pabpc1P29341 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pabpc1P29341 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pabpc1P29341 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pabpc1P29341 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pabpc1P29341 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pabpc1P29341 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Pabpc1P29341 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pabpc1P29341 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pabpc1P29341 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pabpc1P29341 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Pabpc1P29341 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pabpc1P29341 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pabpc1P29341 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pabpc1P29341 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pabpc1P29341 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pabpc1P29341 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Pabpc1P29341 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pabpc1P29341 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms