Protein–RNA interactions for Protein: P29319

Epha3, Ephrin type-A receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha3P29319 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Epha3P29319 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Epha3P29319 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Epha3P29319 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Epha3P29319 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Epha3P29319 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Epha3P29319 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Epha3P29319 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Epha3P29319 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Epha3P29319 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Epha3P29319 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Epha3P29319 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Epha3P29319 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Epha3P29319 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Epha3P29319 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Epha3P29319 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Epha3P29319 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Epha3P29319 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Epha3P29319 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Epha3P29319 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Epha3P29319 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Epha3P29319 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Epha3P29319 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Epha3P29319 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Epha3P29319 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Epha3P29319 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Epha3P29319 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Epha3P29319 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Epha3P29319 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Epha3P29319 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Epha3P29319 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Epha3P29319 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Epha3P29319 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Epha3P29319 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Epha3P29319 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Epha3P29319 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Epha3P29319 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Epha3P29319 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Epha3P29319 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Epha3P29319 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Epha3P29319 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Epha3P29319 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Epha3P29319 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Epha3P29319 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Epha3P29319 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Epha3P29319 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Epha3P29319 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Epha3P29319 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Epha3P29319 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Epha3P29319 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Epha3P29319 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Epha3P29319 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Epha3P29319 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Epha3P29319 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Epha3P29319 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Epha3P29319 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Epha3P29319 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Epha3P29319 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Epha3P29319 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Epha3P29319 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Epha3P29319 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Epha3P29319 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Epha3P29319 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Epha3P29319 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Epha3P29319 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Epha3P29319 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Epha3P29319 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Epha3P29319 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Epha3P29319 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Epha3P29319 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Epha3P29319 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Epha3P29319 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Epha3P29319 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Epha3P29319 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Epha3P29319 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Epha3P29319 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Epha3P29319 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Epha3P29319 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Epha3P29319 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Epha3P29319 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Epha3P29319 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Epha3P29319 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Epha3P29319 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Epha3P29319 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Epha3P29319 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Epha3P29319 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Epha3P29319 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Epha3P29319 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Epha3P29319 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Epha3P29319 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Epha3P29319 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Epha3P29319 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Epha3P29319 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Epha3P29319 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Epha3P29319 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Epha3P29319 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Epha3P29319 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Epha3P29319 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Epha3P29319 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Epha3P29319 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms