Protein–RNA interactions for Protein: P29037

Tbp, TATA-box-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TbpP29037 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TbpP29037 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TbpP29037 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TbpP29037 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TbpP29037 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TbpP29037 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TbpP29037 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TbpP29037 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TbpP29037 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TbpP29037 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TbpP29037 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TbpP29037 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TbpP29037 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TbpP29037 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TbpP29037 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TbpP29037 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TbpP29037 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TbpP29037 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TbpP29037 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TbpP29037 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TbpP29037 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TbpP29037 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TbpP29037 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TbpP29037 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TbpP29037 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TbpP29037 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TbpP29037 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TbpP29037 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TbpP29037 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TbpP29037 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TbpP29037 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TbpP29037 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TbpP29037 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TbpP29037 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TbpP29037 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TbpP29037 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TbpP29037 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TbpP29037 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TbpP29037 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TbpP29037 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TbpP29037 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TbpP29037 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TbpP29037 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TbpP29037 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TbpP29037 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TbpP29037 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TbpP29037 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TbpP29037 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TbpP29037 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TbpP29037 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TbpP29037 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TbpP29037 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TbpP29037 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TbpP29037 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TbpP29037 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TbpP29037 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TbpP29037 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TbpP29037 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TbpP29037 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TbpP29037 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TbpP29037 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TbpP29037 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TbpP29037 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TbpP29037 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TbpP29037 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TbpP29037 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TbpP29037 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TbpP29037 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TbpP29037 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TbpP29037 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TbpP29037 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TbpP29037 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TbpP29037 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TbpP29037 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TbpP29037 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TbpP29037 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TbpP29037 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TbpP29037 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TbpP29037 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TbpP29037 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TbpP29037 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TbpP29037 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TbpP29037 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TbpP29037 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TbpP29037 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TbpP29037 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TbpP29037 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TbpP29037 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TbpP29037 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TbpP29037 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TbpP29037 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TbpP29037 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TbpP29037 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TbpP29037 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TbpP29037 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TbpP29037 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TbpP29037 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TbpP29037 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TbpP29037 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TbpP29037 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms