Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RxrbP28704 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RxrbP28704 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RxrbP28704 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RxrbP28704 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RxrbP28704 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RxrbP28704 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RxrbP28704 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RxrbP28704 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RxrbP28704 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RxrbP28704 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RxrbP28704 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RxrbP28704 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RxrbP28704 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RxrbP28704 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RxrbP28704 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RxrbP28704 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RxrbP28704 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RxrbP28704 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RxrbP28704 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RxrbP28704 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RxrbP28704 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RxrbP28704 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RxrbP28704 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RxrbP28704 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RxrbP28704 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RxrbP28704 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RxrbP28704 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RxrbP28704 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RxrbP28704 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RxrbP28704 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RxrbP28704 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RxrbP28704 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RxrbP28704 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RxrbP28704 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RxrbP28704 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RxrbP28704 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RxrbP28704 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RxrbP28704 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RxrbP28704 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RxrbP28704 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RxrbP28704 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RxrbP28704 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RxrbP28704 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RxrbP28704 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RxrbP28704 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RxrbP28704 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RxrbP28704 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RxrbP28704 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RxrbP28704 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RxrbP28704 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RxrbP28704 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RxrbP28704 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RxrbP28704 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RxrbP28704 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RxrbP28704 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RxrbP28704 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RxrbP28704 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RxrbP28704 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RxrbP28704 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RxrbP28704 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RxrbP28704 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RxrbP28704 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RxrbP28704 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RxrbP28704 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RxrbP28704 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RxrbP28704 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RxrbP28704 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RxrbP28704 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RxrbP28704 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RxrbP28704 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RxrbP28704 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RxrbP28704 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RxrbP28704 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RxrbP28704 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RxrbP28704 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RxrbP28704 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RxrbP28704 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RxrbP28704 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RxrbP28704 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RxrbP28704 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RxrbP28704 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RxrbP28704 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RxrbP28704 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RxrbP28704 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RxrbP28704 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RxrbP28704 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RxrbP28704 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RxrbP28704 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RxrbP28704 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RxrbP28704 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RxrbP28704 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RxrbP28704 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RxrbP28704 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RxrbP28704 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RxrbP28704 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RxrbP28704 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RxrbP28704 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RxrbP28704 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RxrbP28704 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms