Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col2a1P28481 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col2a1P28481 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col2a1P28481 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col2a1P28481 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col2a1P28481 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col2a1P28481 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col2a1P28481 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col2a1P28481 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col2a1P28481 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col2a1P28481 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col2a1P28481 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col2a1P28481 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col2a1P28481 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Col2a1P28481 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Col2a1P28481 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Col2a1P28481 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Col2a1P28481 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Col2a1P28481 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Col2a1P28481 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Col2a1P28481 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col2a1P28481 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col2a1P28481 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col2a1P28481 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col2a1P28481 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col2a1P28481 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Col2a1P28481 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col2a1P28481 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col2a1P28481 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col2a1P28481 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col2a1P28481 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col2a1P28481 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col2a1P28481 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col2a1P28481 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col2a1P28481 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col2a1P28481 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col2a1P28481 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col2a1P28481 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col2a1P28481 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col2a1P28481 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col2a1P28481 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col2a1P28481 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Col2a1P28481 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col2a1P28481 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col2a1P28481 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col2a1P28481 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col2a1P28481 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Col2a1P28481 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Col2a1P28481 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Col2a1P28481 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Col2a1P28481 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col2a1P28481 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col2a1P28481 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col2a1P28481 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col2a1P28481 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Col2a1P28481 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col2a1P28481 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col2a1P28481 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col2a1P28481 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Col2a1P28481 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Col2a1P28481 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Col2a1P28481 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Col2a1P28481 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Col2a1P28481 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Col2a1P28481 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Col2a1P28481 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Col2a1P28481 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Col2a1P28481 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Col2a1P28481 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Col2a1P28481 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Col2a1P28481 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col2a1P28481 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col2a1P28481 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Col2a1P28481 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col2a1P28481 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col2a1P28481 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col2a1P28481 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col2a1P28481 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col2a1P28481 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col2a1P28481 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col2a1P28481 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col2a1P28481 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Col2a1P28481 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col2a1P28481 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col2a1P28481 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col2a1P28481 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col2a1P28481 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col2a1P28481 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col2a1P28481 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col2a1P28481 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col2a1P28481 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col2a1P28481 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Col2a1P28481 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Col2a1P28481 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col2a1P28481 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col2a1P28481 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col2a1P28481 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col2a1P28481 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col2a1P28481 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col2a1P28481 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms