Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxd10P28359 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxd10P28359 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxd10P28359 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxd10P28359 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxd10P28359 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxd10P28359 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxd10P28359 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxd10P28359 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxd10P28359 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxd10P28359 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxd10P28359 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxd10P28359 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxd10P28359 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxd10P28359 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxd10P28359 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxd10P28359 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxd10P28359 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxd10P28359 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxd10P28359 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxd10P28359 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxd10P28359 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxd10P28359 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxd10P28359 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxd10P28359 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxd10P28359 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxd10P28359 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxd10P28359 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxd10P28359 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxd10P28359 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxd10P28359 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxd10P28359 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxd10P28359 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxd10P28359 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxd10P28359 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxd10P28359 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxd10P28359 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxd10P28359 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxd10P28359 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxd10P28359 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxd10P28359 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxd10P28359 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxd10P28359 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxd10P28359 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxd10P28359 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxd10P28359 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxd10P28359 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxd10P28359 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxd10P28359 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxd10P28359 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxd10P28359 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxd10P28359 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxd10P28359 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxd10P28359 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxd10P28359 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxd10P28359 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxd10P28359 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxd10P28359 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxd10P28359 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxd10P28359 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxd10P28359 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxd10P28359 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxd10P28359 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxd10P28359 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxd10P28359 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxd10P28359 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxd10P28359 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxd10P28359 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxd10P28359 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxd10P28359 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxd10P28359 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxd10P28359 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxd10P28359 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxd10P28359 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxd10P28359 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxd10P28359 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxd10P28359 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxd10P28359 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxd10P28359 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxd10P28359 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxd10P28359 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxd10P28359 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxd10P28359 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxd10P28359 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxd10P28359 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxd10P28359 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxd10P28359 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxd10P28359 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxd10P28359 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxd10P28359 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxd10P28359 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxd10P28359 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxd10P28359 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxd10P28359 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxd10P28359 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxd10P28359 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxd10P28359 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxd10P28359 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxd10P28359 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxd10P28359 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
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