Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CftrP26361 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC36.84■■■■□ 3.49
CftrP26361 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
CftrP26361 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CftrP26361 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CftrP26361 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CftrP26361 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
CftrP26361 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC36.83■■■■□ 3.49
CftrP26361 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
CftrP26361 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
CftrP26361 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
CftrP26361 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
CftrP26361 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
CftrP26361 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC36.82■■■■□ 3.49
CftrP26361 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.49
CftrP26361 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
CftrP26361 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
CftrP26361 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.82■■■■□ 3.49
CftrP26361 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
CftrP26361 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
CftrP26361 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
CftrP26361 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC36.81■■■■□ 3.48
CftrP26361 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
CftrP26361 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
CftrP26361 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CftrP26361 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CftrP26361 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CftrP26361 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
CftrP26361 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
CftrP26361 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
CftrP26361 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
CftrP26361 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
CftrP26361 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
CftrP26361 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
CftrP26361 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
CftrP26361 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
CftrP26361 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
CftrP26361 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC36.77■■■■□ 3.48
CftrP26361 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
CftrP26361 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
CftrP26361 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
CftrP26361 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
CftrP26361 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
CftrP26361 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
CftrP26361 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
CftrP26361 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
CftrP26361 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
CftrP26361 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
CftrP26361 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
CftrP26361 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CftrP26361 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CftrP26361 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
CftrP26361 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
CftrP26361 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
CftrP26361 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
CftrP26361 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
CftrP26361 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
CftrP26361 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
CftrP26361 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
CftrP26361 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
CftrP26361 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
CftrP26361 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
CftrP26361 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
CftrP26361 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
CftrP26361 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
CftrP26361 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
CftrP26361 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
CftrP26361 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CftrP26361 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
CftrP26361 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
CftrP26361 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CftrP26361 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CftrP26361 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
CftrP26361 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CftrP26361 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
CftrP26361 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
CftrP26361 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
CftrP26361 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
CftrP26361 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
CftrP26361 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
CftrP26361 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
CftrP26361 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
CftrP26361 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
CftrP26361 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
CftrP26361 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CftrP26361 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CftrP26361 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CftrP26361 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CftrP26361 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
CftrP26361 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CftrP26361 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CftrP26361 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC36.6■■■■□ 3.45
CftrP26361 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CftrP26361 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC36.6■■■■□ 3.45
CftrP26361 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
CftrP26361 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CftrP26361 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CftrP26361 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CftrP26361 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
CftrP26361 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms